RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295688.7

CCT3-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT3, Length 2,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3-201ENST00000295688 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.34■■□□□ 1.01
CCT3-201ENST00000295688 MAPKBP1O60336 1514 aa21.33■■□□□ 1.01
CCT3-201ENST00000295688 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.3■■□□□ 1
CCT3-201ENST00000295688 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.26■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.25■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.22■□□□□ 0.99
CCT3-201ENST00000295688 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.995e-8■■■■■ 30.7
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CCT3-201ENST00000295688 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.19■□□□□ 0.98
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CCT3-201ENST00000295688 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.19■□□□□ 0.98
CCT3-201ENST00000295688 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.18■□□□□ 0.98
CCT3-201ENST00000295688 CUL7Q14999 1698 aa21.18■□□□□ 0.98
CCT3-201ENST00000295688 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.17■□□□□ 0.98
CCT3-201ENST00000295688 WDR97A6NE52 1622 aa21.14■□□□□ 0.98
CCT3-201ENST00000295688 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.13■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.1■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 FMN1Q68DA7 1419 aa21.1■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 P3H3Q8IVL6 736 aa21.09■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.09■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 TOPBP1Q92547 1522 aa21.08■□□□□ 0.97
CCT3-201ENST00000295688 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCT3-201ENST00000295688 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
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CCT3-201ENST00000295688 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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CCT3-201ENST00000295688 KCNH8Q96L42 1107 aa20.98■□□□□ 0.95
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CCT3-201ENST00000295688 HFM1A2PYH4 1435 aa20.96■□□□□ 0.95
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CCT3-201ENST00000295688 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.96■□□□□ 0.95
CCT3-201ENST00000295688 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
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CCT3-201ENST00000295688 ANP32CO43423 234 aa20.95■□□□□ 0.94
CCT3-201ENST00000295688 SAMD9Q5K651 1589 aa20.95■□□□□ 0.94
CCT3-201ENST00000295688 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.92■□□□□ 0.94
CCT3-201ENST00000295688 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.91■□□□□ 0.94
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CCT3-201ENST00000295688 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.89■□□□□ 0.93
CCT3-201ENST00000295688 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.88■□□□□ 0.93
CCT3-201ENST00000295688 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.88■□□□□ 0.93
CCT3-201ENST00000295688 GRIN2BQ13224 1484 aa20.88■□□□□ 0.93
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CCT3-201ENST00000295688 NCOA2Q15596 1464 aa20.87■□□□□ 0.93
CCT3-201ENST00000295688 NESP48681 1621 aa20.86■□□□□ 0.93
CCT3-201ENST00000295688 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.85■□□□□ 0.93
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CCT3-201ENST00000295688 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.84■□□□□ 0.93
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CCT3-201ENST00000295688 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCT3-201ENST00000295688 ARHGEF11O15085 1522 aa20.78■□□□□ 0.92
CCT3-201ENST00000295688 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.76■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.74■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 AKNAQ7Z591 1439 aa20.74■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 BCANQ96GW7 911 aa20.72■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 HECW1Q76N89 1606 aa20.72■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.71■□□□□ 0.91
CCT3-201ENST00000295688 TRIM52Q96A61 297 aa20.7■□□□□ 0.9
CCT3-201ENST00000295688 MIA2Q96PC5 1412 aa20.68■□□□□ 0.9
CCT3-201ENST00000295688 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.65■□□□□ 0.9
CCT3-201ENST00000295688 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCT3-201ENST00000295688 IQGAP2Q13576 1575 aa20.61■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.61■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 PBRM1Q86U86 1689 aa20.6■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCT3-201ENST00000295688 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.56■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.56■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.56■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.55■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 WDR62O43379 1518 aa20.55■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 ROCK1Q13464 1354 aa20.54■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.53■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 ADAMTS12P58397 1594 aa20.53■□□□□ 0.88
CCT3-201ENST00000295688 KDM6BO15054 1643 aa20.51■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 NCOA1Q15788 1441 aa20.48■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.48■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 DAPK1P53355 1430 aa20.46■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCT3-201ENST00000295688 CCDC7Q96M83 1385 aa20.45■□□□□ 0.87
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