RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036992.8

Lmo1-201, Transcript of Rhombotin-1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo1, Length 1,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Necap1Q9CR95 275 aa14.72□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cldn34c4A2ANA3 212 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 EndogO08600 294 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ufd1P70362 307 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 St8sia3Q64689 380 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mmp28Q8CGV8 520 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1466Q8VFW4 310 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1242Q8VGM6 306 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Bpifa5Q9CQX3 270 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Vmn1r194J3JS27 296 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Kcnk3O35111 409 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 CenpaO35216 134 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Vamp1Q62442 118 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Vmn1r35Q8R2E2 296 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1238Q8VG59 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1271Q8VG62 305 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mgat4cQ9D306 478 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cd5lQ9QWK4 352 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Pkd1l1Q8R526 2615 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tcrg-C4A0A075B6C7 190 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 P06335 190 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Nhlh2Q64221 135 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tgfbr1Q64729 503 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lrtm2Q8BGX3 370 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Slamf7Q8BHK6 333 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Scgb1b27Q91WB5 92 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cmtm3Q99LJ5 184 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Atp5sQ9CRA7 200 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Golt1aQ9DCQ3 133 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Tmem201A2A8U2 664 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm21767J3QPV5 180 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Prrt1O35449 306 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 H2-Q10P01898 325 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ly6c2P0CW03 131 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ntf3P20181 258 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Hmx3P42581 356 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Hist1h1bP43276 223 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Spam1P48794 512 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Dynlt3P56387 116 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ndufb6Q3UIU2 128 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 SepsecsQ6P6M7 504 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rnase2aQ8K196 155 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Zcchc12Q9CZA5 402 aa14.68□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm29106A0A087WSP8 697 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 A0A286YDM5 308 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Obp1bA2AEP0 171 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm14743A2BHD2 171 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 H60bB1B212 251 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gfi1bO70237 330 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Bpifa2P07743 235 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 VhlP40338 181 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cav3P51637 151 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 BaxQ07813 192 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Nxph3Q91VX5 252 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rab27bQ99P58 218 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 HpgdsQ9JHF7 199 aa14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cldn34c3J3QJW5 233 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cldn34c2J3QNM1 233 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Efnb2P52800 336 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Npas1P97459 594 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mettl4Q3U034 471 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm20816Q5FWD4 227 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lcn3Q62471 182 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Q80W69 301 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Cldn34c1Q8K193 234 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Pdcd10Q8VE70 212 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Eva1aQ91WM6 156 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mus81Q91ZJ0 551 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Smim3Q99PE5 60 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Sp6Q9ESX2 376 aa14.66□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rarres1F6ZIS7 283 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm20821J3QPJ2 227 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 ApcsP12246 224 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rtl4Q3URY0 304 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 MyocosQ3UWS6 143 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Diras2Q5PR73 199 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Foxc2Q61850 494 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Olfr1099Q8VG37 312 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mtfp1Q9CRB8 166 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 PerpQ9JK95 193 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Trem3Q9JKE1 183 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa14.65□□□□□ -0.06
Lmo1-201ENSMUST00000036992 4933408B17RikG3X9B4 273 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm9602J3QPD5 205 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Gm10553J3QPF1 123 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Mamld1P0C6A2 803 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Rab3dP35276 219 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 Bmpr1bP36898 502 aa14.64□□□□□ -0.07
Lmo1-201ENSMUST00000036992 BC100530Q497J0 97 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46 ms