Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab27bQ99P58 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rab27bQ99P58 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rab27bQ99P58 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rab27bQ99P58 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Rab27bQ99P58 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Rab27bQ99P58 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rab27bQ99P58 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rab27bQ99P58 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab27bQ99P58 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rab27bQ99P58 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rab27bQ99P58 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Rab27bQ99P58 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rab27bQ99P58 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rab27bQ99P58 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rab27bQ99P58 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Rab27bQ99P58 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab27bQ99P58 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab27bQ99P58 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rab27bQ99P58 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Rab27bQ99P58 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Rab27bQ99P58 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rab27bQ99P58 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Rab27bQ99P58 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab27bQ99P58 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Rab27bQ99P58 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Rab27bQ99P58 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Rab27bQ99P58 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Rab27bQ99P58 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Rab27bQ99P58 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Rab27bQ99P58 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Rab27bQ99P58 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
Rab27bQ99P58 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Rab27bQ99P58 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Rab27bQ99P58 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rab27bQ99P58 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rab27bQ99P58 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rab27bQ99P58 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rab27bQ99P58 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Rab27bQ99P58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rab27bQ99P58 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rab27bQ99P58 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rab27bQ99P58 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Rab27bQ99P58 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Rab27bQ99P58 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Rab27bQ99P58 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Rab27bQ99P58 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rab27bQ99P58 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab27bQ99P58 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rab27bQ99P58 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,35
Rab27bQ99P58 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rab27bQ99P58 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rab27bQ99P58 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Rab27bQ99P58 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Rab27bQ99P58 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rab27bQ99P58 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Rab27bQ99P58 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rab27bQ99P58 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Rab27bQ99P58 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rab27bQ99P58 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rab27bQ99P58 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Rab27bQ99P58 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Rab27bQ99P58 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Rab27bQ99P58 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Rab27bQ99P58 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Rab27bQ99P58 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Rab27bQ99P58 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Rab27bQ99P58 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Rab27bQ99P58 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Rab27bQ99P58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Rab27bQ99P58 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Rab27bQ99P58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Rab27bQ99P58 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Rab27bQ99P58 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Rab27bQ99P58 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Rab27bQ99P58 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Rab27bQ99P58 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Rab27bQ99P58 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Rab27bQ99P58 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Rab27bQ99P58 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Rab27bQ99P58 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Rab27bQ99P58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,58■■□□□ 1,2
Rab27bQ99P58 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Rab27bQ99P58 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Rab27bQ99P58 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Rab27bQ99P58 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Rab27bQ99P58 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Rab27bQ99P58 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Rab27bQ99P58 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Rab27bQ99P58 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Rab27bQ99P58 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Rab27bQ99P58 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Rab27bQ99P58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Rab27bQ99P58 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Rab27bQ99P58 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Rab27bQ99P58 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Rab27bQ99P58 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Rab27bQ99P58 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Rab27bQ99P58 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Rab27bQ99P58 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms