Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv5-16A0A0B4J1P4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Ighv5-16A0A0B4J1P4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,08■■□□□ 1,12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
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