Protein–RNA interactions for Protein: P52800

Efnb2, Ephrin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb2P52800 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Efnb2P52800 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Efnb2P52800 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efnb2P52800 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efnb2P52800 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Efnb2P52800 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Efnb2P52800 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Efnb2P52800 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Efnb2P52800 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Efnb2P52800 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efnb2P52800 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efnb2P52800 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efnb2P52800 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Efnb2P52800 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efnb2P52800 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efnb2P52800 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Efnb2P52800 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efnb2P52800 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Efnb2P52800 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efnb2P52800 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efnb2P52800 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efnb2P52800 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efnb2P52800 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efnb2P52800 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efnb2P52800 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Efnb2P52800 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efnb2P52800 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efnb2P52800 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efnb2P52800 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efnb2P52800 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efnb2P52800 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Efnb2P52800 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efnb2P52800 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efnb2P52800 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efnb2P52800 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efnb2P52800 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efnb2P52800 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efnb2P52800 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efnb2P52800 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Efnb2P52800 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efnb2P52800 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efnb2P52800 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Efnb2P52800 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efnb2P52800 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efnb2P52800 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efnb2P52800 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efnb2P52800 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efnb2P52800 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Efnb2P52800 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efnb2P52800 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Efnb2P52800 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efnb2P52800 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efnb2P52800 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efnb2P52800 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Efnb2P52800 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efnb2P52800 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Efnb2P52800 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Efnb2P52800 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Efnb2P52800 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efnb2P52800 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efnb2P52800 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efnb2P52800 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Efnb2P52800 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Efnb2P52800 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efnb2P52800 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Efnb2P52800 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb2P52800 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efnb2P52800 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Efnb2P52800 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efnb2P52800 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efnb2P52800 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Efnb2P52800 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Efnb2P52800 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Efnb2P52800 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Efnb2P52800 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Efnb2P52800 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efnb2P52800 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efnb2P52800 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efnb2P52800 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efnb2P52800 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Efnb2P52800 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efnb2P52800 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efnb2P52800 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efnb2P52800 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efnb2P52800 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efnb2P52800 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efnb2P52800 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efnb2P52800 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efnb2P52800 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efnb2P52800 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efnb2P52800 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efnb2P52800 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efnb2P52800 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efnb2P52800 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efnb2P52800 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efnb2P52800 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efnb2P52800 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efnb2P52800 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efnb2P52800 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efnb2P52800 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms