Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Zcchc12Q9CZA5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Zcchc12Q9CZA5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Zcchc12Q9CZA5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Zcchc12Q9CZA5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Zcchc12Q9CZA5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Zcchc12Q9CZA5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Zcchc12Q9CZA5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Zcchc12Q9CZA5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Zcchc12Q9CZA5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Zcchc12Q9CZA5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Zcchc12Q9CZA5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Zcchc12Q9CZA5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Zcchc12Q9CZA5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Zcchc12Q9CZA5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Zcchc12Q9CZA5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Zcchc12Q9CZA5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Zcchc12Q9CZA5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Zcchc12Q9CZA5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Zcchc12Q9CZA5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Zcchc12Q9CZA5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Zcchc12Q9CZA5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Zcchc12Q9CZA5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Zcchc12Q9CZA5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Zcchc12Q9CZA5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Zcchc12Q9CZA5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Zcchc12Q9CZA5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Zcchc12Q9CZA5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Zcchc12Q9CZA5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Zcchc12Q9CZA5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Zcchc12Q9CZA5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Zcchc12Q9CZA5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Zcchc12Q9CZA5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Zcchc12Q9CZA5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Zcchc12Q9CZA5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Zcchc12Q9CZA5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Zcchc12Q9CZA5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Zcchc12Q9CZA5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Zcchc12Q9CZA5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Zcchc12Q9CZA5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Zcchc12Q9CZA5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Zcchc12Q9CZA5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Zcchc12Q9CZA5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Zcchc12Q9CZA5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Zcchc12Q9CZA5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Zcchc12Q9CZA5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Zcchc12Q9CZA5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Zcchc12Q9CZA5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Zcchc12Q9CZA5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Zcchc12Q9CZA5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Zcchc12Q9CZA5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Zcchc12Q9CZA5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Zcchc12Q9CZA5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Zcchc12Q9CZA5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Zcchc12Q9CZA5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Zcchc12Q9CZA5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Zcchc12Q9CZA5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Zcchc12Q9CZA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Zcchc12Q9CZA5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Zcchc12Q9CZA5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Zcchc12Q9CZA5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Zcchc12Q9CZA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Zcchc12Q9CZA5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Zcchc12Q9CZA5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Zcchc12Q9CZA5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Zcchc12Q9CZA5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Zcchc12Q9CZA5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Zcchc12Q9CZA5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Zcchc12Q9CZA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Zcchc12Q9CZA5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Zcchc12Q9CZA5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Zcchc12Q9CZA5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Zcchc12Q9CZA5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Zcchc12Q9CZA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Zcchc12Q9CZA5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Zcchc12Q9CZA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Zcchc12Q9CZA5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Zcchc12Q9CZA5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Zcchc12Q9CZA5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Zcchc12Q9CZA5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Zcchc12Q9CZA5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Zcchc12Q9CZA5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Zcchc12Q9CZA5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Zcchc12Q9CZA5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Zcchc12Q9CZA5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms