Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cldn34c2J3QNM1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cldn34c2J3QNM1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cldn34c2J3QNM1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cldn34c2J3QNM1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn34c2J3QNM1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn34c2J3QNM1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn34c2J3QNM1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn34c2J3QNM1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn34c2J3QNM1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn34c2J3QNM1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn34c2J3QNM1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn34c2J3QNM1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn34c2J3QNM1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cldn34c2J3QNM1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn34c2J3QNM1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cldn34c2J3QNM1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn34c2J3QNM1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn34c2J3QNM1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cldn34c2J3QNM1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cldn34c2J3QNM1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cldn34c2J3QNM1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn34c2J3QNM1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn34c2J3QNM1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn34c2J3QNM1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn34c2J3QNM1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn34c2J3QNM1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn34c2J3QNM1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn34c2J3QNM1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn34c2J3QNM1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn34c2J3QNM1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn34c2J3QNM1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn34c2J3QNM1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn34c2J3QNM1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34c2J3QNM1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34c2J3QNM1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34c2J3QNM1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cldn34c2J3QNM1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34c2J3QNM1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34c2J3QNM1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34c2J3QNM1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34c2J3QNM1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn34c2J3QNM1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34c2J3QNM1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn34c2J3QNM1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn34c2J3QNM1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34c2J3QNM1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34c2J3QNM1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn34c2J3QNM1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn34c2J3QNM1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn34c2J3QNM1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn34c2J3QNM1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34c2J3QNM1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn34c2J3QNM1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34c2J3QNM1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34c2J3QNM1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34c2J3QNM1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34c2J3QNM1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34c2J3QNM1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34c2J3QNM1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34c2J3QNM1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn34c2J3QNM1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34c2J3QNM1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn34c2J3QNM1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34c2J3QNM1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34c2J3QNM1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34c2J3QNM1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34c2J3QNM1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34c2J3QNM1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34c2J3QNM1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34c2J3QNM1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34c2J3QNM1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34c2J3QNM1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34c2J3QNM1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34c2J3QNM1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34c2J3QNM1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn34c2J3QNM1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn34c2J3QNM1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn34c2J3QNM1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn34c2J3QNM1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34c2J3QNM1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn34c2J3QNM1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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