Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tgfbr1Q64729 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfbr1Q64729 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfbr1Q64729 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfbr1Q64729 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgfbr1Q64729 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgfbr1Q64729 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgfbr1Q64729 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgfbr1Q64729 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfbr1Q64729 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tgfbr1Q64729 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tgfbr1Q64729 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tgfbr1Q64729 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tgfbr1Q64729 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfbr1Q64729 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfbr1Q64729 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfbr1Q64729 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfbr1Q64729 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfbr1Q64729 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfbr1Q64729 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgfbr1Q64729 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgfbr1Q64729 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfbr1Q64729 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfbr1Q64729 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfbr1Q64729 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfbr1Q64729 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tgfbr1Q64729 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfbr1Q64729 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tgfbr1Q64729 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfbr1Q64729 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tgfbr1Q64729 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfbr1Q64729 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgfbr1Q64729 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tgfbr1Q64729 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgfbr1Q64729 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tgfbr1Q64729 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgfbr1Q64729 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgfbr1Q64729 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgfbr1Q64729 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgfbr1Q64729 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgfbr1Q64729 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgfbr1Q64729 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfbr1Q64729 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfbr1Q64729 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfbr1Q64729 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfbr1Q64729 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr1Q64729 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfbr1Q64729 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr1Q64729 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfbr1Q64729 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfbr1Q64729 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfbr1Q64729 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr1Q64729 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfbr1Q64729 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfbr1Q64729 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfbr1Q64729 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfbr1Q64729 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfbr1Q64729 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgfbr1Q64729 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfbr1Q64729 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfbr1Q64729 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr1Q64729 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfbr1Q64729 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfbr1Q64729 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfbr1Q64729 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfbr1Q64729 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgfbr1Q64729 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfbr1Q64729 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfbr1Q64729 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfbr1Q64729 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr1Q64729 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfbr1Q64729 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfbr1Q64729 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgfbr1Q64729 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tgfbr1Q64729 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr1Q64729 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgfbr1Q64729 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgfbr1Q64729 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr1Q64729 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr1Q64729 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr1Q64729 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfbr1Q64729 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr1Q64729 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr1Q64729 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr1Q64729 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr1Q64729 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr1Q64729 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr1Q64729 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfbr1Q64729 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfbr1Q64729 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfbr1Q64729 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfbr1Q64729 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfbr1Q64729 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfbr1Q64729 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfbr1Q64729 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms