Protein–RNA interactions for Protein: P51637

Cav3, Caveolin-3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav3P51637 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cav3P51637 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cav3P51637 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cav3P51637 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cav3P51637 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cav3P51637 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cav3P51637 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cav3P51637 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cav3P51637 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cav3P51637 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cav3P51637 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cav3P51637 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cav3P51637 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cav3P51637 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cav3P51637 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cav3P51637 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cav3P51637 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cav3P51637 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cav3P51637 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cav3P51637 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cav3P51637 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cav3P51637 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cav3P51637 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cav3P51637 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cav3P51637 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cav3P51637 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cav3P51637 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cav3P51637 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cav3P51637 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cav3P51637 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cav3P51637 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cav3P51637 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cav3P51637 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cav3P51637 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cav3P51637 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cav3P51637 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cav3P51637 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cav3P51637 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cav3P51637 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cav3P51637 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cav3P51637 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cav3P51637 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cav3P51637 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cav3P51637 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cav3P51637 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cav3P51637 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cav3P51637 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav3P51637 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cav3P51637 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cav3P51637 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cav3P51637 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cav3P51637 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cav3P51637 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cav3P51637 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cav3P51637 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cav3P51637 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cav3P51637 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cav3P51637 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cav3P51637 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cav3P51637 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cav3P51637 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cav3P51637 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cav3P51637 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cav3P51637 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cav3P51637 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cav3P51637 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cav3P51637 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cav3P51637 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cav3P51637 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cav3P51637 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cav3P51637 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cav3P51637 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cav3P51637 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cav3P51637 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cav3P51637 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cav3P51637 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cav3P51637 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cav3P51637 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cav3P51637 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cav3P51637 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cav3P51637 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cav3P51637 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cav3P51637 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cav3P51637 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cav3P51637 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav3P51637 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cav3P51637 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav3P51637 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cav3P51637 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cav3P51637 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cav3P51637 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav3P51637 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav3P51637 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cav3P51637 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cav3P51637 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cav3P51637 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cav3P51637 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cav3P51637 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cav3P51637 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cav3P51637 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms