Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gfi1bO70237 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gfi1bO70237 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gfi1bO70237 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gfi1bO70237 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gfi1bO70237 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gfi1bO70237 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfi1bO70237 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gfi1bO70237 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gfi1bO70237 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gfi1bO70237 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gfi1bO70237 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gfi1bO70237 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gfi1bO70237 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfi1bO70237 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gfi1bO70237 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gfi1bO70237 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gfi1bO70237 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gfi1bO70237 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gfi1bO70237 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gfi1bO70237 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfi1bO70237 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gfi1bO70237 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gfi1bO70237 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfi1bO70237 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfi1bO70237 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gfi1bO70237 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gfi1bO70237 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfi1bO70237 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfi1bO70237 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gfi1bO70237 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gfi1bO70237 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfi1bO70237 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gfi1bO70237 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfi1bO70237 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfi1bO70237 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gfi1bO70237 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfi1bO70237 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfi1bO70237 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfi1bO70237 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfi1bO70237 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfi1bO70237 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfi1bO70237 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfi1bO70237 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfi1bO70237 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfi1bO70237 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfi1bO70237 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfi1bO70237 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfi1bO70237 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfi1bO70237 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfi1bO70237 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfi1bO70237 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfi1bO70237 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfi1bO70237 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfi1bO70237 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfi1bO70237 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfi1bO70237 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfi1bO70237 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfi1bO70237 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfi1bO70237 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gfi1bO70237 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfi1bO70237 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfi1bO70237 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gfi1bO70237 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gfi1bO70237 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gfi1bO70237 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gfi1bO70237 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfi1bO70237 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1bO70237 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfi1bO70237 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfi1bO70237 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfi1bO70237 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfi1bO70237 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfi1bO70237 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfi1bO70237 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfi1bO70237 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfi1bO70237 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfi1bO70237 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gfi1bO70237 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfi1bO70237 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gfi1bO70237 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gfi1bO70237 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gfi1bO70237 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfi1bO70237 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfi1bO70237 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gfi1bO70237 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfi1bO70237 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfi1bO70237 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfi1bO70237 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfi1bO70237 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfi1bO70237 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfi1bO70237 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1bO70237 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfi1bO70237 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfi1bO70237 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfi1bO70237 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms