Protein–RNA interactions for Protein: Q64689

St8sia3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St8sia3Q64689 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
St8sia3Q64689 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
St8sia3Q64689 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
St8sia3Q64689 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
St8sia3Q64689 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
St8sia3Q64689 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
St8sia3Q64689 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
St8sia3Q64689 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
St8sia3Q64689 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
St8sia3Q64689 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
St8sia3Q64689 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
St8sia3Q64689 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
St8sia3Q64689 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
St8sia3Q64689 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
St8sia3Q64689 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
St8sia3Q64689 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
St8sia3Q64689 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
St8sia3Q64689 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
St8sia3Q64689 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
St8sia3Q64689 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
St8sia3Q64689 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
St8sia3Q64689 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
St8sia3Q64689 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
St8sia3Q64689 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
St8sia3Q64689 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
St8sia3Q64689 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
St8sia3Q64689 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
St8sia3Q64689 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
St8sia3Q64689 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
St8sia3Q64689 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
St8sia3Q64689 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
St8sia3Q64689 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
St8sia3Q64689 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
St8sia3Q64689 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
St8sia3Q64689 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
St8sia3Q64689 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
St8sia3Q64689 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St8sia3Q64689 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
St8sia3Q64689 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
St8sia3Q64689 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
St8sia3Q64689 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
St8sia3Q64689 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
St8sia3Q64689 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St8sia3Q64689 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
St8sia3Q64689 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
St8sia3Q64689 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
St8sia3Q64689 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
St8sia3Q64689 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
St8sia3Q64689 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
St8sia3Q64689 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
St8sia3Q64689 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
St8sia3Q64689 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
St8sia3Q64689 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
St8sia3Q64689 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
St8sia3Q64689 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
St8sia3Q64689 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
St8sia3Q64689 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
St8sia3Q64689 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
St8sia3Q64689 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
St8sia3Q64689 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
St8sia3Q64689 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
St8sia3Q64689 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
St8sia3Q64689 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
St8sia3Q64689 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
St8sia3Q64689 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
St8sia3Q64689 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
St8sia3Q64689 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
St8sia3Q64689 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
St8sia3Q64689 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
St8sia3Q64689 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St8sia3Q64689 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
St8sia3Q64689 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
St8sia3Q64689 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
St8sia3Q64689 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
St8sia3Q64689 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
St8sia3Q64689 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
St8sia3Q64689 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
St8sia3Q64689 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
St8sia3Q64689 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
St8sia3Q64689 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
St8sia3Q64689 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
St8sia3Q64689 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
St8sia3Q64689 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
St8sia3Q64689 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
St8sia3Q64689 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
St8sia3Q64689 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
St8sia3Q64689 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
St8sia3Q64689 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
St8sia3Q64689 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
St8sia3Q64689 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
St8sia3Q64689 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
St8sia3Q64689 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
St8sia3Q64689 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
St8sia3Q64689 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
St8sia3Q64689 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
St8sia3Q64689 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
St8sia3Q64689 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
St8sia3Q64689 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
St8sia3Q64689 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
St8sia3Q64689 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms