Protein–RNA interactions for Protein: P48794

Spam1, Hyaluronidase PH-20, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spam1P48794 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Spam1P48794 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spam1P48794 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spam1P48794 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spam1P48794 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spam1P48794 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Spam1P48794 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spam1P48794 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spam1P48794 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spam1P48794 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spam1P48794 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spam1P48794 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spam1P48794 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spam1P48794 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Spam1P48794 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Spam1P48794 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spam1P48794 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spam1P48794 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spam1P48794 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spam1P48794 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spam1P48794 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Spam1P48794 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spam1P48794 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spam1P48794 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spam1P48794 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spam1P48794 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spam1P48794 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spam1P48794 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spam1P48794 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spam1P48794 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spam1P48794 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spam1P48794 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spam1P48794 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spam1P48794 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spam1P48794 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spam1P48794 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Spam1P48794 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spam1P48794 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spam1P48794 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spam1P48794 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spam1P48794 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spam1P48794 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spam1P48794 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spam1P48794 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spam1P48794 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spam1P48794 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spam1P48794 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spam1P48794 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spam1P48794 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spam1P48794 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spam1P48794 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spam1P48794 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spam1P48794 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spam1P48794 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spam1P48794 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spam1P48794 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spam1P48794 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spam1P48794 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spam1P48794 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spam1P48794 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spam1P48794 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spam1P48794 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spam1P48794 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spam1P48794 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spam1P48794 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spam1P48794 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spam1P48794 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spam1P48794 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spam1P48794 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spam1P48794 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spam1P48794 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spam1P48794 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spam1P48794 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spam1P48794 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spam1P48794 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spam1P48794 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spam1P48794 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spam1P48794 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spam1P48794 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spam1P48794 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spam1P48794 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spam1P48794 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spam1P48794 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spam1P48794 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spam1P48794 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spam1P48794 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spam1P48794 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spam1P48794 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spam1P48794 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spam1P48794 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spam1P48794 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spam1P48794 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spam1P48794 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spam1P48794 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spam1P48794 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spam1P48794 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spam1P48794 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spam1P48794 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spam1P48794 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spam1P48794 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms