Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ntf3P20181 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ntf3P20181 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ntf3P20181 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ntf3P20181 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Ntf3P20181 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ntf3P20181 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Ntf3P20181 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ntf3P20181 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ntf3P20181 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ntf3P20181 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ntf3P20181 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ntf3P20181 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ntf3P20181 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ntf3P20181 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ntf3P20181 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ntf3P20181 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ntf3P20181 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ntf3P20181 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ntf3P20181 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ntf3P20181 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Ntf3P20181 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ntf3P20181 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ntf3P20181 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ntf3P20181 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ntf3P20181 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Ntf3P20181 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ntf3P20181 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ntf3P20181 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ntf3P20181 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ntf3P20181 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ntf3P20181 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ntf3P20181 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ntf3P20181 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Ntf3P20181 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ntf3P20181 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ntf3P20181 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ntf3P20181 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ntf3P20181 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ntf3P20181 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ntf3P20181 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ntf3P20181 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ntf3P20181 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ntf3P20181 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Ntf3P20181 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Ntf3P20181 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ntf3P20181 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ntf3P20181 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ntf3P20181 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ntf3P20181 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ntf3P20181 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ntf3P20181 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ntf3P20181 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ntf3P20181 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ntf3P20181 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Ntf3P20181 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ntf3P20181 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ntf3P20181 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ntf3P20181 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ntf3P20181 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ntf3P20181 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ntf3P20181 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ntf3P20181 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ntf3P20181 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ntf3P20181 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ntf3P20181 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Ntf3P20181 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ntf3P20181 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ntf3P20181 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ntf3P20181 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ntf3P20181 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ntf3P20181 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ntf3P20181 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Ntf3P20181 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ntf3P20181 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ntf3P20181 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ntf3P20181 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Ntf3P20181 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Ntf3P20181 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ntf3P20181 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ntf3P20181 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ntf3P20181 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ntf3P20181 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ntf3P20181 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ntf3P20181 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ntf3P20181 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ntf3P20181 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ntf3P20181 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ntf3P20181 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ntf3P20181 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ntf3P20181 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ntf3P20181 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ntf3P20181 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Ntf3P20181 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ntf3P20181 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms