Protein–RNA interactions for Protein: P16110

Lgals3, Galectin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals3P16110 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lgals3P16110 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lgals3P16110 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgals3P16110 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lgals3P16110 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgals3P16110 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgals3P16110 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lgals3P16110 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgals3P16110 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgals3P16110 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgals3P16110 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lgals3P16110 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgals3P16110 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lgals3P16110 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lgals3P16110 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lgals3P16110 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgals3P16110 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lgals3P16110 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgals3P16110 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgals3P16110 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgals3P16110 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgals3P16110 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgals3P16110 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgals3P16110 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgals3P16110 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgals3P16110 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgals3P16110 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgals3P16110 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgals3P16110 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgals3P16110 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgals3P16110 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lgals3P16110 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgals3P16110 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgals3P16110 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgals3P16110 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgals3P16110 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgals3P16110 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lgals3P16110 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgals3P16110 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgals3P16110 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgals3P16110 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgals3P16110 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgals3P16110 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lgals3P16110 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgals3P16110 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lgals3P16110 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lgals3P16110 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lgals3P16110 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lgals3P16110 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgals3P16110 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lgals3P16110 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lgals3P16110 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lgals3P16110 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lgals3P16110 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lgals3P16110 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgals3P16110 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgals3P16110 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgals3P16110 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgals3P16110 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgals3P16110 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgals3P16110 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgals3P16110 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgals3P16110 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgals3P16110 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgals3P16110 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgals3P16110 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgals3P16110 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgals3P16110 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgals3P16110 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgals3P16110 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgals3P16110 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgals3P16110 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgals3P16110 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgals3P16110 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgals3P16110 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgals3P16110 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgals3P16110 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgals3P16110 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgals3P16110 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgals3P16110 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgals3P16110 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgals3P16110 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgals3P16110 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgals3P16110 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgals3P16110 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgals3P16110 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgals3P16110 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgals3P16110 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgals3P16110 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgals3P16110 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgals3P16110 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgals3P16110 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgals3P16110 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lgals3P16110 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lgals3P16110 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms