Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hmx3P42581 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hmx3P42581 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmx3P42581 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmx3P42581 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmx3P42581 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx3P42581 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmx3P42581 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmx3P42581 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmx3P42581 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmx3P42581 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmx3P42581 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmx3P42581 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx3P42581 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmx3P42581 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmx3P42581 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmx3P42581 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx3P42581 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx3P42581 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmx3P42581 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx3P42581 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx3P42581 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx3P42581 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx3P42581 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx3P42581 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx3P42581 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx3P42581 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx3P42581 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx3P42581 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hmx3P42581 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmx3P42581 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx3P42581 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx3P42581 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx3P42581 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx3P42581 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmx3P42581 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmx3P42581 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmx3P42581 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmx3P42581 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmx3P42581 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmx3P42581 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmx3P42581 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmx3P42581 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmx3P42581 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmx3P42581 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmx3P42581 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx3P42581 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmx3P42581 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmx3P42581 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx3P42581 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmx3P42581 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmx3P42581 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmx3P42581 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmx3P42581 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmx3P42581 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmx3P42581 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmx3P42581 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmx3P42581 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx3P42581 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmx3P42581 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmx3P42581 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmx3P42581 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmx3P42581 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmx3P42581 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmx3P42581 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx3P42581 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmx3P42581 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmx3P42581 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmx3P42581 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmx3P42581 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx3P42581 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmx3P42581 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmx3P42581 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx3P42581 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx3P42581 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx3P42581 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmx3P42581 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmx3P42581 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx3P42581 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmx3P42581 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmx3P42581 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx3P42581 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmx3P42581 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmx3P42581 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmx3P42581 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx3P42581 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmx3P42581 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmx3P42581 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx3P42581 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx3P42581 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmx3P42581 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmx3P42581 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmx3P42581 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmx3P42581 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmx3P42581 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmx3P42581 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx3P42581 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx3P42581 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx3P42581 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx3P42581 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms