Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK95

Perp, p53 apoptosis effector related to PMP-22, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PerpQ9JK95 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
PerpQ9JK95 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
PerpQ9JK95 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
PerpQ9JK95 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
PerpQ9JK95 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
PerpQ9JK95 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
PerpQ9JK95 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
PerpQ9JK95 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
PerpQ9JK95 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
PerpQ9JK95 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
PerpQ9JK95 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
PerpQ9JK95 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
PerpQ9JK95 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
PerpQ9JK95 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
PerpQ9JK95 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
PerpQ9JK95 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
PerpQ9JK95 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
PerpQ9JK95 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
PerpQ9JK95 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
PerpQ9JK95 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
PerpQ9JK95 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
PerpQ9JK95 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
PerpQ9JK95 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
PerpQ9JK95 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
PerpQ9JK95 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
PerpQ9JK95 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
PerpQ9JK95 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PerpQ9JK95 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
PerpQ9JK95 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
PerpQ9JK95 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
PerpQ9JK95 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
PerpQ9JK95 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
PerpQ9JK95 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
PerpQ9JK95 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
PerpQ9JK95 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
PerpQ9JK95 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PerpQ9JK95 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,81■■□□□ 1,24
PerpQ9JK95 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
PerpQ9JK95 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PerpQ9JK95 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,6■■□□□ 1,21
PerpQ9JK95 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
PerpQ9JK95 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,39■■□□□ 1,17
PerpQ9JK95 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PerpQ9JK95 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PerpQ9JK95 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PerpQ9JK95 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,3■■□□□ 1,16
PerpQ9JK95 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
PerpQ9JK95 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
PerpQ9JK95 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
PerpQ9JK95 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
PerpQ9JK95 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,13■■□□□ 1,13
PerpQ9JK95 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
PerpQ9JK95 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,06■■□□□ 1,12
PerpQ9JK95 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
PerpQ9JK95 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
PerpQ9JK95 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
PerpQ9JK95 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
PerpQ9JK95 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
PerpQ9JK95 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
PerpQ9JK95 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
PerpQ9JK95 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
PerpQ9JK95 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
PerpQ9JK95 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
PerpQ9JK95 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
PerpQ9JK95 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
PerpQ9JK95 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
PerpQ9JK95 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
PerpQ9JK95 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
PerpQ9JK95 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
PerpQ9JK95 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PerpQ9JK95 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,61■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
PerpQ9JK95 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
PerpQ9JK95 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
PerpQ9JK95 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
PerpQ9JK95 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
PerpQ9JK95 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
PerpQ9JK95 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,42■■□□□ 1,02
PerpQ9JK95 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,4■■□□□ 1,02
PerpQ9JK95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
PerpQ9JK95 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
PerpQ9JK95 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
PerpQ9JK95 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
PerpQ9JK95 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
PerpQ9JK95 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
PerpQ9JK95 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,29■■□□□ 1
PerpQ9JK95 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,8 ms