Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BC100530Q497J0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BC100530Q497J0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BC100530Q497J0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BC100530Q497J0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC100530Q497J0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BC100530Q497J0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC100530Q497J0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC100530Q497J0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC100530Q497J0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BC100530Q497J0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BC100530Q497J0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BC100530Q497J0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC100530Q497J0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BC100530Q497J0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC100530Q497J0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BC100530Q497J0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC100530Q497J0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC100530Q497J0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BC100530Q497J0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BC100530Q497J0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BC100530Q497J0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BC100530Q497J0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC100530Q497J0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC100530Q497J0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC100530Q497J0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC100530Q497J0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC100530Q497J0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC100530Q497J0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC100530Q497J0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BC100530Q497J0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC100530Q497J0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC100530Q497J0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC100530Q497J0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC100530Q497J0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC100530Q497J0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC100530Q497J0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC100530Q497J0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC100530Q497J0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC100530Q497J0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC100530Q497J0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC100530Q497J0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC100530Q497J0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BC100530Q497J0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC100530Q497J0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC100530Q497J0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC100530Q497J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC100530Q497J0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC100530Q497J0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC100530Q497J0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC100530Q497J0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC100530Q497J0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC100530Q497J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC100530Q497J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC100530Q497J0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC100530Q497J0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BC100530Q497J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC100530Q497J0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC100530Q497J0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC100530Q497J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BC100530Q497J0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC100530Q497J0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC100530Q497J0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC100530Q497J0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC100530Q497J0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC100530Q497J0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC100530Q497J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC100530Q497J0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC100530Q497J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC100530Q497J0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC100530Q497J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC100530Q497J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC100530Q497J0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC100530Q497J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BC100530Q497J0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC100530Q497J0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC100530Q497J0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC100530Q497J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC100530Q497J0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC100530Q497J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC100530Q497J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC100530Q497J0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC100530Q497J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC100530Q497J0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC100530Q497J0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC100530Q497J0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BC100530Q497J0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC100530Q497J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC100530Q497J0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC100530Q497J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC100530Q497J0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC100530Q497J0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC100530Q497J0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC100530Q497J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC100530Q497J0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC100530Q497J0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC100530Q497J0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC100530Q497J0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC100530Q497J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BC100530Q497J0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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