Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Mpdu1Q9R0Q9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mpdu1Q9R0Q9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mpdu1Q9R0Q9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mpdu1Q9R0Q9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mpdu1Q9R0Q9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mpdu1Q9R0Q9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mpdu1Q9R0Q9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mpdu1Q9R0Q9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mpdu1Q9R0Q9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mpdu1Q9R0Q9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mpdu1Q9R0Q9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mpdu1Q9R0Q9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mpdu1Q9R0Q9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mpdu1Q9R0Q9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mpdu1Q9R0Q9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mpdu1Q9R0Q9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mpdu1Q9R0Q9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mpdu1Q9R0Q9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mpdu1Q9R0Q9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mpdu1Q9R0Q9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mpdu1Q9R0Q9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mpdu1Q9R0Q9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mpdu1Q9R0Q9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mpdu1Q9R0Q9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mpdu1Q9R0Q9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mpdu1Q9R0Q9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mpdu1Q9R0Q9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mpdu1Q9R0Q9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mpdu1Q9R0Q9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mpdu1Q9R0Q9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mpdu1Q9R0Q9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mpdu1Q9R0Q9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mpdu1Q9R0Q9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mpdu1Q9R0Q9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mpdu1Q9R0Q9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mpdu1Q9R0Q9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mpdu1Q9R0Q9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mpdu1Q9R0Q9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mpdu1Q9R0Q9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mpdu1Q9R0Q9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mpdu1Q9R0Q9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mpdu1Q9R0Q9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mpdu1Q9R0Q9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mpdu1Q9R0Q9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mpdu1Q9R0Q9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mpdu1Q9R0Q9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mpdu1Q9R0Q9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mpdu1Q9R0Q9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mpdu1Q9R0Q9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mpdu1Q9R0Q9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mpdu1Q9R0Q9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mpdu1Q9R0Q9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mpdu1Q9R0Q9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mpdu1Q9R0Q9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mpdu1Q9R0Q9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mpdu1Q9R0Q9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mpdu1Q9R0Q9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mpdu1Q9R0Q9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mpdu1Q9R0Q9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mpdu1Q9R0Q9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mpdu1Q9R0Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mpdu1Q9R0Q9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mpdu1Q9R0Q9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mpdu1Q9R0Q9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mpdu1Q9R0Q9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mpdu1Q9R0Q9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mpdu1Q9R0Q9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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