RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Josd1Q9DBJ6 202 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf385cA2A5E6 429 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csrp3P50462 194 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tac3P55099 116 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm1673Q3UR78 90 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 March11Q8CBH7 400 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TifabQ8JZM6 147 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trbv5A0A0B4J1G9 113 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ldlrad3A2AR95 345 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spint5J3KMK8 105 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4791J3QQ14 102 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plekhb1Q9QYE9 243 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr918E9PVZ7 325 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21775J3KMK6 180 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01725 110 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P18526 117 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp386Q1WWJ5 626 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdzd11Q9CZG9 140 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trem3Q9JKE1 183 aa9.28□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10666K7N6B8 321 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acaa1bQ8VCH0 424 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr916Q8VG53 310 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr476Q8VGI4 310 aa9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acaa1aQ921H8 424 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr715bE9Q725 315 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam240aJ3QNP9 97 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igsf6P0C6B7 237 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smim19Q80ZU4 107 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdcp2Q8BQH6 427 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb6Q91VD6 63 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9DAL9 119 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Malrd1A2AJX4 2123 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bcl2l10Q9Z0F3 191 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cldn34c4A2ANA3 212 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ceacam12Q3UKP4 300 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr823Q7TRH2 315 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr824Q8VFU4 315 aa9.27□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r235Q8R297 328 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr279Q8VFD8 310 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DapQ91XC8 102 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lurap1Q9D6I9 239 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lyrm7Q9DA03 104 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sumo3Q9Z172 110 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr905L7N1X5 310 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tgfbr1Q64729 503 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AdtrpQ8C138 230 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb8Q91V82 60 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smdt1Q9DB10 107 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Apc2Q9Z1K7 2274 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav12-1A0N8R1 115 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Edn3P48299 214 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r181Q0P547 304 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SlaQ60898 281 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sdf2l1Q9ESP1 221 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam89bQ9QUI1 189 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Iqcf6G3UWF2 157 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ankrd66J3QNN4 192 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UngP97931 306 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dlx1Q64317 255 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mob4Q6PEB6 225 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Urm1Q9D2P4 101 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnal4Q9DCM4 105 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm12728V9GX31 77 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sult2a4L7N245 285 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cxcl13O55038 109 aa9.26□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tdrd6P61407 2134 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp942B8JJA7 486 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr432E9Q8M2 312 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdkn1aP39689 159 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Asphd1Q2TA57 360 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1009Q8VFK1 314 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cldn16Q925N4 235 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr175-ps1A0A140T8K4 308 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm14412A2ARR7 526 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8VCE4 163 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Unc119Q9Z2R6 240 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 A730046J19RikA0A1B0GSN8 89 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC049730Q810N3 246 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Myoz1Q9JK37 296 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Crim1Q9JLL0 1037 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm14124A2AU83 715 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700084M14RikB1AT01 78 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp867E9Q2M4 473 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1537P34983 314 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PcolceQ61398 468 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MiaQ61865 130 aa9.25□□□□□ -0.93
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ceacam9Q78T27 234 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.3 ms