Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shisal2bQ9D1Y9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shisal2bQ9D1Y9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shisal2bQ9D1Y9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shisal2bQ9D1Y9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Shisal2bQ9D1Y9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shisal2bQ9D1Y9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Shisal2bQ9D1Y9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shisal2bQ9D1Y9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shisal2bQ9D1Y9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shisal2bQ9D1Y9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shisal2bQ9D1Y9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shisal2bQ9D1Y9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shisal2bQ9D1Y9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shisal2bQ9D1Y9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shisal2bQ9D1Y9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisal2bQ9D1Y9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Shisal2bQ9D1Y9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisal2bQ9D1Y9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Shisal2bQ9D1Y9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shisal2bQ9D1Y9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisal2bQ9D1Y9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisal2bQ9D1Y9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shisal2bQ9D1Y9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shisal2bQ9D1Y9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shisal2bQ9D1Y9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shisal2bQ9D1Y9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shisal2bQ9D1Y9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shisal2bQ9D1Y9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shisal2bQ9D1Y9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shisal2bQ9D1Y9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shisal2bQ9D1Y9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shisal2bQ9D1Y9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shisal2bQ9D1Y9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shisal2bQ9D1Y9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shisal2bQ9D1Y9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shisal2bQ9D1Y9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shisal2bQ9D1Y9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shisal2bQ9D1Y9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shisal2bQ9D1Y9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shisal2bQ9D1Y9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shisal2bQ9D1Y9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shisal2bQ9D1Y9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisal2bQ9D1Y9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shisal2bQ9D1Y9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shisal2bQ9D1Y9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shisal2bQ9D1Y9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shisal2bQ9D1Y9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shisal2bQ9D1Y9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shisal2bQ9D1Y9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shisal2bQ9D1Y9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shisal2bQ9D1Y9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shisal2bQ9D1Y9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shisal2bQ9D1Y9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisal2bQ9D1Y9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisal2bQ9D1Y9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shisal2bQ9D1Y9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shisal2bQ9D1Y9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shisal2bQ9D1Y9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shisal2bQ9D1Y9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisal2bQ9D1Y9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisal2bQ9D1Y9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shisal2bQ9D1Y9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shisal2bQ9D1Y9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shisal2bQ9D1Y9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms