Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trbv5A0A0B4J1G9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trbv5A0A0B4J1G9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trbv5A0A0B4J1G9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trbv5A0A0B4J1G9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trbv5A0A0B4J1G9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trbv5A0A0B4J1G9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trbv5A0A0B4J1G9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trbv5A0A0B4J1G9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trbv5A0A0B4J1G9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trbv5A0A0B4J1G9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trbv5A0A0B4J1G9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trbv5A0A0B4J1G9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trbv5A0A0B4J1G9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trbv5A0A0B4J1G9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trbv5A0A0B4J1G9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trbv5A0A0B4J1G9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trbv5A0A0B4J1G9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trbv5A0A0B4J1G9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trbv5A0A0B4J1G9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trbv5A0A0B4J1G9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trbv5A0A0B4J1G9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trbv5A0A0B4J1G9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trbv5A0A0B4J1G9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trbv5A0A0B4J1G9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trbv5A0A0B4J1G9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trbv5A0A0B4J1G9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trbv5A0A0B4J1G9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trbv5A0A0B4J1G9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trbv5A0A0B4J1G9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbv5A0A0B4J1G9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbv5A0A0B4J1G9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trbv5A0A0B4J1G9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trbv5A0A0B4J1G9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv5A0A0B4J1G9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv5A0A0B4J1G9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv5A0A0B4J1G9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv5A0A0B4J1G9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv5A0A0B4J1G9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv5A0A0B4J1G9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trbv5A0A0B4J1G9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv5A0A0B4J1G9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv5A0A0B4J1G9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv5A0A0B4J1G9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv5A0A0B4J1G9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv5A0A0B4J1G9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv5A0A0B4J1G9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv5A0A0B4J1G9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trbv5A0A0B4J1G9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv5A0A0B4J1G9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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