Protein–RNA interactions for Protein: Q60898

Sla, Src-like-adapter, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlaQ60898 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SlaQ60898 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SlaQ60898 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SlaQ60898 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SlaQ60898 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SlaQ60898 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SlaQ60898 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SlaQ60898 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SlaQ60898 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SlaQ60898 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SlaQ60898 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SlaQ60898 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SlaQ60898 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SlaQ60898 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SlaQ60898 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SlaQ60898 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SlaQ60898 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlaQ60898 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SlaQ60898 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SlaQ60898 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlaQ60898 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlaQ60898 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SlaQ60898 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SlaQ60898 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SlaQ60898 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SlaQ60898 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SlaQ60898 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SlaQ60898 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SlaQ60898 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SlaQ60898 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SlaQ60898 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SlaQ60898 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SlaQ60898 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SlaQ60898 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SlaQ60898 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SlaQ60898 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SlaQ60898 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlaQ60898 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlaQ60898 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SlaQ60898 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlaQ60898 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SlaQ60898 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SlaQ60898 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlaQ60898 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlaQ60898 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SlaQ60898 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlaQ60898 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlaQ60898 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SlaQ60898 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlaQ60898 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SlaQ60898 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlaQ60898 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlaQ60898 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlaQ60898 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SlaQ60898 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SlaQ60898 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SlaQ60898 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SlaQ60898 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlaQ60898 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlaQ60898 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlaQ60898 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SlaQ60898 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlaQ60898 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlaQ60898 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlaQ60898 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlaQ60898 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SlaQ60898 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlaQ60898 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SlaQ60898 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SlaQ60898 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlaQ60898 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SlaQ60898 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SlaQ60898 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SlaQ60898 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SlaQ60898 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SlaQ60898 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SlaQ60898 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SlaQ60898 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlaQ60898 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlaQ60898 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlaQ60898 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SlaQ60898 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms