Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PcolceQ61398 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PcolceQ61398 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PcolceQ61398 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PcolceQ61398 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PcolceQ61398 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PcolceQ61398 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PcolceQ61398 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PcolceQ61398 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PcolceQ61398 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PcolceQ61398 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PcolceQ61398 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PcolceQ61398 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PcolceQ61398 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PcolceQ61398 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PcolceQ61398 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PcolceQ61398 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PcolceQ61398 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PcolceQ61398 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PcolceQ61398 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PcolceQ61398 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PcolceQ61398 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PcolceQ61398 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PcolceQ61398 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PcolceQ61398 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PcolceQ61398 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PcolceQ61398 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PcolceQ61398 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PcolceQ61398 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PcolceQ61398 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PcolceQ61398 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PcolceQ61398 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PcolceQ61398 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PcolceQ61398 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PcolceQ61398 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PcolceQ61398 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PcolceQ61398 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PcolceQ61398 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PcolceQ61398 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PcolceQ61398 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PcolceQ61398 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcolceQ61398 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PcolceQ61398 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PcolceQ61398 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcolceQ61398 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PcolceQ61398 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcolceQ61398 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PcolceQ61398 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcolceQ61398 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcolceQ61398 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PcolceQ61398 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PcolceQ61398 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PcolceQ61398 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PcolceQ61398 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PcolceQ61398 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PcolceQ61398 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PcolceQ61398 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PcolceQ61398 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PcolceQ61398 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PcolceQ61398 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcolceQ61398 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PcolceQ61398 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PcolceQ61398 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PcolceQ61398 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcolceQ61398 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PcolceQ61398 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcolceQ61398 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcolceQ61398 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PcolceQ61398 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcolceQ61398 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcolceQ61398 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PcolceQ61398 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcolceQ61398 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcolceQ61398 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PcolceQ61398 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcolceQ61398 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcolceQ61398 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcolceQ61398 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PcolceQ61398 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PcolceQ61398 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PcolceQ61398 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PcolceQ61398 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PcolceQ61398 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PcolceQ61398 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PcolceQ61398 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PcolceQ61398 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PcolceQ61398 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PcolceQ61398 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PcolceQ61398 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PcolceQ61398 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PcolceQ61398 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PcolceQ61398 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PcolceQ61398 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PcolceQ61398 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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