Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESP1

Sdf2l1, Stromal cell-derived factor 2-like protein 1, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2l1Q9ESP1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Sdf2l1Q9ESP1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sdf2l1Q9ESP1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Sdf2l1Q9ESP1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Sdf2l1Q9ESP1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Sdf2l1Q9ESP1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Sdf2l1Q9ESP1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Sdf2l1Q9ESP1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Sdf2l1Q9ESP1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Sdf2l1Q9ESP1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Sdf2l1Q9ESP1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Sdf2l1Q9ESP1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Sdf2l1Q9ESP1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Sdf2l1Q9ESP1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Sdf2l1Q9ESP1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Sdf2l1Q9ESP1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sdf2l1Q9ESP1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Sdf2l1Q9ESP1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Sdf2l1Q9ESP1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Sdf2l1Q9ESP1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sdf2l1Q9ESP1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sdf2l1Q9ESP1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Sdf2l1Q9ESP1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Sdf2l1Q9ESP1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Sdf2l1Q9ESP1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Sdf2l1Q9ESP1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdf2l1Q9ESP1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Sdf2l1Q9ESP1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Sdf2l1Q9ESP1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Sdf2l1Q9ESP1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Sdf2l1Q9ESP1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Sdf2l1Q9ESP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Sdf2l1Q9ESP1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Sdf2l1Q9ESP1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Sdf2l1Q9ESP1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Sdf2l1Q9ESP1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Sdf2l1Q9ESP1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Sdf2l1Q9ESP1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Sdf2l1Q9ESP1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Sdf2l1Q9ESP1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Sdf2l1Q9ESP1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Sdf2l1Q9ESP1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Sdf2l1Q9ESP1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Sdf2l1Q9ESP1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Sdf2l1Q9ESP1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Sdf2l1Q9ESP1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Sdf2l1Q9ESP1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Sdf2l1Q9ESP1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Sdf2l1Q9ESP1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Sdf2l1Q9ESP1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Sdf2l1Q9ESP1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Sdf2l1Q9ESP1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Sdf2l1Q9ESP1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Sdf2l1Q9ESP1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Sdf2l1Q9ESP1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Sdf2l1Q9ESP1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Sdf2l1Q9ESP1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Sdf2l1Q9ESP1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Sdf2l1Q9ESP1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Sdf2l1Q9ESP1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sdf2l1Q9ESP1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sdf2l1Q9ESP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Sdf2l1Q9ESP1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Sdf2l1Q9ESP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Sdf2l1Q9ESP1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Sdf2l1Q9ESP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Sdf2l1Q9ESP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Sdf2l1Q9ESP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Sdf2l1Q9ESP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Sdf2l1Q9ESP1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Sdf2l1Q9ESP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Sdf2l1Q9ESP1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Sdf2l1Q9ESP1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Sdf2l1Q9ESP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sdf2l1Q9ESP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Sdf2l1Q9ESP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Sdf2l1Q9ESP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Sdf2l1Q9ESP1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Sdf2l1Q9ESP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Sdf2l1Q9ESP1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Sdf2l1Q9ESP1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Sdf2l1Q9ESP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Sdf2l1Q9ESP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Sdf2l1Q9ESP1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
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