Protein–RNA interactions for Protein: A2AJX4

Malrd1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malrd1A2AJX4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,37■■■■■ 4,37
Malrd1A2AJX4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Malrd1A2AJX4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
Malrd1A2AJX4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,02■■■■□ 3,52
Malrd1A2AJX4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Malrd1A2AJX4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Malrd1A2AJX4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,76■■■■□ 3,32
Malrd1A2AJX4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Malrd1A2AJX4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Malrd1A2AJX4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Malrd1A2AJX4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Malrd1A2AJX4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Malrd1A2AJX4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Malrd1A2AJX4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Malrd1A2AJX4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Malrd1A2AJX4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Malrd1A2AJX4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Malrd1A2AJX4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Malrd1A2AJX4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Malrd1A2AJX4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Malrd1A2AJX4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Malrd1A2AJX4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Malrd1A2AJX4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Malrd1A2AJX4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Malrd1A2AJX4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Malrd1A2AJX4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Malrd1A2AJX4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Malrd1A2AJX4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Malrd1A2AJX4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
Malrd1A2AJX4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Malrd1A2AJX4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Malrd1A2AJX4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Malrd1A2AJX4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Malrd1A2AJX4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Malrd1A2AJX4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Malrd1A2AJX4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Malrd1A2AJX4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Malrd1A2AJX4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Malrd1A2AJX4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Malrd1A2AJX4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Malrd1A2AJX4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Malrd1A2AJX4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Malrd1A2AJX4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Malrd1A2AJX4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,9■■■□□ 2,7
Malrd1A2AJX4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Malrd1A2AJX4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Malrd1A2AJX4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Malrd1A2AJX4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Malrd1A2AJX4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Malrd1A2AJX4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Malrd1A2AJX4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Malrd1A2AJX4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Malrd1A2AJX4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Malrd1A2AJX4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Malrd1A2AJX4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Malrd1A2AJX4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Malrd1A2AJX4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Malrd1A2AJX4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Malrd1A2AJX4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Malrd1A2AJX4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Malrd1A2AJX4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Malrd1A2AJX4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Malrd1A2AJX4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Malrd1A2AJX4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Malrd1A2AJX4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Malrd1A2AJX4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Malrd1A2AJX4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Malrd1A2AJX4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Malrd1A2AJX4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Malrd1A2AJX4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Malrd1A2AJX4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Malrd1A2AJX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Malrd1A2AJX4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Malrd1A2AJX4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Malrd1A2AJX4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Malrd1A2AJX4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Malrd1A2AJX4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Malrd1A2AJX4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Malrd1A2AJX4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Malrd1A2AJX4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Malrd1A2AJX4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Malrd1A2AJX4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Malrd1A2AJX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Malrd1A2AJX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Malrd1A2AJX4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Malrd1A2AJX4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Malrd1A2AJX4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Malrd1A2AJX4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Malrd1A2AJX4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Malrd1A2AJX4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Malrd1A2AJX4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Malrd1A2AJX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Malrd1A2AJX4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Malrd1A2AJX4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Malrd1A2AJX4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Malrd1A2AJX4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Malrd1A2AJX4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Malrd1A2AJX4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Malrd1A2AJX4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Malrd1A2AJX4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms