Protein–RNA interactions for Protein: P55099

Tac3, Tachykinin-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac3P55099 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tac3P55099 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tac3P55099 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tac3P55099 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tac3P55099 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tac3P55099 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tac3P55099 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tac3P55099 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tac3P55099 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tac3P55099 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac3P55099 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tac3P55099 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tac3P55099 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tac3P55099 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tac3P55099 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tac3P55099 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac3P55099 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tac3P55099 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tac3P55099 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tac3P55099 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac3P55099 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tac3P55099 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tac3P55099 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tac3P55099 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tac3P55099 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac3P55099 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tac3P55099 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tac3P55099 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tac3P55099 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tac3P55099 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tac3P55099 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tac3P55099 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tac3P55099 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tac3P55099 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tac3P55099 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tac3P55099 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tac3P55099 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tac3P55099 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tac3P55099 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tac3P55099 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac3P55099 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tac3P55099 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tac3P55099 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tac3P55099 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tac3P55099 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tac3P55099 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tac3P55099 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tac3P55099 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tac3P55099 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tac3P55099 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac3P55099 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tac3P55099 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tac3P55099 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tac3P55099 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tac3P55099 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tac3P55099 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac3P55099 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tac3P55099 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac3P55099 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac3P55099 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tac3P55099 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac3P55099 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac3P55099 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tac3P55099 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac3P55099 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tac3P55099 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac3P55099 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tac3P55099 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tac3P55099 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac3P55099 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tac3P55099 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac3P55099 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tac3P55099 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tac3P55099 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tac3P55099 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tac3P55099 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tac3P55099 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tac3P55099 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tac3P55099 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tac3P55099 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tac3P55099 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tac3P55099 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tac3P55099 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tac3P55099 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tac3P55099 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tac3P55099 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tac3P55099 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tac3P55099 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tac3P55099 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 500.9 ms