Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY41

Ighv1-47, Immunoglobulin heavy variable 1-47 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Ighv1-47A0A0A6YY41 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ighv1-47A0A0A6YY41 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ighv1-47A0A0A6YY41 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ighv1-47A0A0A6YY41 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ighv1-47A0A0A6YY41 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ighv1-47A0A0A6YY41 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ighv1-47A0A0A6YY41 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Ighv1-47A0A0A6YY41 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ighv1-47A0A0A6YY41 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Ighv1-47A0A0A6YY41 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ighv1-47A0A0A6YY41 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Ighv1-47A0A0A6YY41 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ighv1-47A0A0A6YY41 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ighv1-47A0A0A6YY41 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ighv1-47A0A0A6YY41 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ighv1-47A0A0A6YY41 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ighv1-47A0A0A6YY41 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ighv1-47A0A0A6YY41 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ighv1-47A0A0A6YY41 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ighv1-47A0A0A6YY41 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ighv1-47A0A0A6YY41 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ighv1-47A0A0A6YY41 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ighv1-47A0A0A6YY41 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ighv1-47A0A0A6YY41 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ighv1-47A0A0A6YY41 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ighv1-47A0A0A6YY41 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ighv1-47A0A0A6YY41 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ighv1-47A0A0A6YY41 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Ighv1-47A0A0A6YY41 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ighv1-47A0A0A6YY41 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ighv1-47A0A0A6YY41 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Ighv1-47A0A0A6YY41 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv1-47A0A0A6YY41 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ighv1-47A0A0A6YY41 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ighv1-47A0A0A6YY41 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ighv1-47A0A0A6YY41 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv1-47A0A0A6YY41 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Ighv1-47A0A0A6YY41 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv1-47A0A0A6YY41 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv1-47A0A0A6YY41 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ighv1-47A0A0A6YY41 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ighv1-47A0A0A6YY41 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv1-47A0A0A6YY41 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv1-47A0A0A6YY41 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv1-47A0A0A6YY41 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ighv1-47A0A0A6YY41 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv1-47A0A0A6YY41 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ighv1-47A0A0A6YY41 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-47A0A0A6YY41 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-47A0A0A6YY41 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv1-47A0A0A6YY41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv1-47A0A0A6YY41 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ighv1-47A0A0A6YY41 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv1-47A0A0A6YY41 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv1-47A0A0A6YY41 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv1-47A0A0A6YY41 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ighv1-47A0A0A6YY41 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv1-47A0A0A6YY41 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ighv1-47A0A0A6YY41 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv1-47A0A0A6YY41 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv1-47A0A0A6YY41 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv1-47A0A0A6YY41 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ighv1-47A0A0A6YY41 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-47A0A0A6YY41 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-47A0A0A6YY41 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ighv1-47A0A0A6YY41 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
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