RNA–Protein interactions for RNA: YOL063C

CRT10, Transcript of Protein involved in transcriptional regulation of RNR2 and RNR3, yeast

Gene CRT10, Length 2,874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRT10	YOL063C	YSC84	P32793	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RIM2	P38127	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YBR259W	P38338	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YBR285W	P38354	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PAN5	P38787	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PIK1	P39104	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UBP7	P40453	1071 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	ORC5	P50874	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YET3	Q07451	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RCN2	Q12044	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HER1	Q12276	1246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CRT10	YOL063C	HMG2	P12684	1045 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RSR1	P13856	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	CHS2	P14180	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YPK3	P38070	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YBR138C	P38277	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	VMA22	P38784	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UBP9	P39967	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TGL3	P40308	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	MAD3	P47074	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YGR273C	P53329	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HST2	P53686	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	IVY1	Q04934	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SEC10	Q06245	871 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SGO1	Q08490	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SNT1	P25357	1226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
CRT10	YOL063C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YBL036C	P38197	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PFF1	P38244	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YBR242W	P38331	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	FAA2	P39518	744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SER33	P40510	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BRE2	P43132	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YJL045W	P47052	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DAN4	P47179	1161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	NSG2	P53898	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	MMT1	Q03218	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	NTO1	Q12311	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BBP1	Q12365	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	AVL9	Q12500	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	CMK2	P22517	447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	VPS3	P23643	1011 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HXT7	P39004	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TMA108	P40462	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	FAR3	P46671	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GAL83	Q04739	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	CDA1	Q06702	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	ENT1	Q12518	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	HSF1	P10961	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	SRM1	P21827	482 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	KRE2	P27809	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	RRN6	P32786	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	VPS45	P38932	577 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	SEO1	P39709	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	CHS6	P40955	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	AGP3	P43548	558 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	PUS2	P53167	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	IMA2	Q08295	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	SNF4	P12904	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRT10	YOL063C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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