RNA–Protein interactions for RNA: YJL138C

TIF2, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF2	YJL138C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	CEP3	P40969	608 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SCS3	P53012	380 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NUC1	P08466	329 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	IMP2'	P32351	346 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SHP1	P34223	423 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	VPS45	P38932	577 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PIK1	P39104	1066 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ROG3	P43602	733 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PIB2	P53191	635 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YGR035C	P53222	116 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ENV11	P53246	860 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	LSB1	P53281	241 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	TRS130	Q03660	1102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SYT1	Q06836	1226 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YDR056C	Q12025	205 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NUR1	Q12066	484 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PHO3	P24031	467 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NFU1	P32860	256 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	RRN3	P36070	627 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ERR3	P42222	437 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	HXT16	P47185	567 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	AZR1	P50080	613 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	LIF1	P53150	421 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	MRPS35	P53292	345 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	MSC2	Q03455	724 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	MED1	Q12321	566 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.04	□□□□□ -1.28	not detected
TIF2	YJL138C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	MOT1	P32333	1867 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SWI6	P09959	803 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YCL002C	P25565	263 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	YKR051W	P36142	418 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	REG2	P38232	338 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SMK1	P41808	388 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ZIP2	P53061	704 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SFB2	P53953	876 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	ARP7	Q12406	477 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	NHA1	Q99271	985 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TIF2	YJL138C	SPS1	P08458	490 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SNF5	P18480	905 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MIH1	P23748	554 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SYN8	P31377	255 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	XRS2	P33301	854 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MDJ1	P35191	511 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.02	□□□□□ -1.29	not detected
TIF2	YJL138C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SGM1	P47166	707 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.02	□□□□□ -1.29	RIP-Chip
TIF2	YJL138C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	NSI1	Q12457	570 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	RIT1	P23796	513 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	FUB1	P25659	250 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	ANP1	P32629	500 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SLC1	P33333	303 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	FLR1	P38124	548 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	STB5	P38699	743 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	7.01	□□□□□ -1.29	not detected
TIF2	YJL138C	YFL054C	P43549	646 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	HLR1	Q04429	423 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	ATG11	Q12527	1178 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	ACE2	P21192	770 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	TOA1	P32773	286 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	APM3	P38153	483 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	ESL1	P40456	1118 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	YIR007W	P40566	764 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	VTC2	P43585	828 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	PCL10	P53124	433 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	OMS1	Q06668	471 aa		7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MYO1	P08964	1928 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MAS2	P11914	482 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	DGR2	P32330	852 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MRPL36	P36531	177 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	YHL012W	P38709	493 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	STL1	P39932	569 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	NPP2	P39997	493 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	FMS1	P50264	508 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TIF2	YJL138C	MEP3	P53390	489 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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