RNA–Protein interactions for RNA: YHL006C

SHU1, Transcript of Component of Shu complex (aka PCSS complex), yeast

Gene SHU1, Length 453 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHU1	YHL006C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	EXO1	P39875	702 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	YIL054W	P40524	105 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	PEX31	P53203	462 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	KTR7	P40504	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	CNN1	P43618	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	HPF1	Q05164	967 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	YLR012C	Q07927	99 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	RSB1	Q08417	382 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SHU1	YHL006C	PPX1	P38698	397 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	LAM1	P38851	1228 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SNG1	P46950	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	MRX6	P48564	524 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	BET4	Q00618	327 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SMA1	Q02651	245 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	RKM2	Q03942	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SWC5	P38326	303 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PRM9	P39551	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ATG3	P40344	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PEX15	Q08215	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	CIR2	Q08822	631 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PIK1	P39104	1066 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	THI21	Q08975	551 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PIN2	Q12057	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	TEL1	P38110	2787 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YJU3	P28321	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ASG1	P40467	964 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	NPY1	P53164	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PEX13	P80667	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SND1	Q04007	877 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SAK1	P38990	1142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	CDC55	Q00362	526 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ADI1	Q03677	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ERV41	Q04651	352 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PER33	Q12144	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SEC63	P14906	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ADY2	P25613	283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	RSM7	P47150	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	AMA1	P50082	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YGR021W	P53212	290 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	ERG5	P54781	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	OPY2	Q06810	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	RAD3	P06839	778 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	VAC8	P39968	578 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	DAN4	P47179	1161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	NUP84	P52891	726 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YNL108C	P53929	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YDR278C	Q05612	105 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	YLR046C	Q12253	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SHU1	YHL006C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	SPC110	P32380	944 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	KHA1	P40309	873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	AIM23	P47015	356 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	YNR063W	P53749	607 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	DOS2	P54858	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	YMR018W	Q04364	514 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	APL4	Q12028	832 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	DAL81	P21657	970 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	RML2	P32611	393 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	MRPL40	P36534	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	ERP2	P39704	215 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	PIR1	Q03178	341 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	INP2	Q03824	705 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	YPR148C	Q06523	435 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	GEX1	P25596	615 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	GEX2	P36173	615 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	RRT5	P43607	289 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SHU1	YHL006C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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