RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)N

tL(CAA)N, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tL(CAA)N, Length 82 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tL(CAA)NtL(CAA)N NBP1P52919 319 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N MNT2P53059 558 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N MTO1P53070 669 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N EMC4P53073 190 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N UBP10P53874 792 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N YCS4Q06156 1176 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N MCP2Q06567 569 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N THI73Q07904 523 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N ABP140Q08641 628 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N YPL272CQ08984 517 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N SRO7Q12038 1033 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N GLE1Q12315 538 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N SKM1Q12469 655 aa4.04□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N HSP82P02829 709 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N ABF1P14164 731 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N LRE1P25579 583 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N VBA3P25594 458 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N HSP78P33416 811 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N VBA5P36172 582 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N NBP35P52920 328 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N TBF1Q02457 562 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N YPL062WQ02781 134 aa4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N RPN8Q08723 338 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tL(CAA)NtL(CAA)N CDC42P19073 191 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N EFB1P32471 206 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TTI1P36097 1038 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TAE1P38340 232 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N FTR1P40088 404 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SPO22P40511 975 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SMC3P47037 1230 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YJR054WP47114 497 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ARP5P53946 755 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PIR1Q03178 341 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N RSM10Q03201 203 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TRS23Q03784 219 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PEX15Q08215 383 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SLX4Q12098 748 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TRS33Q99394 268 aa4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N CYR1P08678 2026 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N NAT1P12945 854 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YCL042WP25572 119 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N CDC11P32458 415 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data4.01□□□□□ -1.77not detected
tL(CAA)NtL(CAA)N PMT1P33775 817 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YBR053CP38235 358 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N UBP14P38237 781 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N RRP3P38712 501 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N KAP123P40069 1113 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PRK1P40494 810 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N KTR7P40504 517 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SPG5P42933 373 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PFD1P46988 109 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N COG7P53195 279 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YNL092WP53934 400 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ELP4Q02884 456 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N GNT1Q12096 491 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N GIS3Q12418 502 aa4.01□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TRL1P09880 827 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N URA1P28272 314 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ASF1P32447 279 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PXA2P34230 853 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PIM1P36775 1133 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SSP1P38871 571 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N RSM25P40496 264 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YFL034WP43564 1073 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N VTC4P47075 721 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N AMA1P50082 593 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N DON1Q05610 365 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N RGA2Q06407 1009 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ATG10Q07879 167 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SIL1Q08199 421 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N VPS54Q12071 889 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TMS1Q12116 473 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N YLR046CQ12253 270 aa4□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N FOB1O13329 566 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SUC2P00724 532 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N GEX1P25596 615 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N SWI3P32591 825 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N GEX2P36173 615 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N URA8P38627 578 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N ELO1P39540 310 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N DAK2P43550 591 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N BIR1P47134 954 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TIM8P57744 87 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N STP3Q05937 343 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N TRE1Q08919 783 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N HMI1Q12039 706 aa3.99□□□□□ -1.77
tL(CAA)NtL(CAA)N PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.99□□□□□ -1.77not detected
tL(CAA)NtL(CAA)N NBL1Q3E7Y6 73 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms