RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W SDH5Q08230 162 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W REC8Q12188 680 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MOT1P32333 1867 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W POL3P15436 1097 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W HEM15P16622 393 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SLA2P33338 968 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W DUG2P38149 878 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SAW1P39735 261 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SIP5P40210 489 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RSM26P47141 266 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YGR035CP53222 116 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SPC98P53540 846 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W FMP25Q08023 583 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RRD2Q12461 358 aa9.76□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YCR015CP25616 317 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MGT1P26188 188 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TPS2P31688 896 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W AVT2P39981 480 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W ALY2P47029 1046 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YNL115CP53925 644 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W COG6P53959 839 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YPL062WQ02781 134 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YMR027WQ04371 470 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W PIG1Q06216 648 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W CDC73Q06697 393 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W APC5Q08683 685 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W THI21Q08975 551 aa9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W LAA1P39526 2014 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W HAP2P06774 265 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W CIT2P08679 460 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W PEX2P32800 271 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W POA1P38218 177 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W HSL7P38274 827 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SLX1P38324 304 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W BRL1P38770 471 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SPO74P45819 413 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TRS85P46944 698 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YNL011CP53980 444 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RKM2Q03942 479 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W THI20Q08224 551 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MPC54Q08550 464 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W AVL9Q12500 764 aa9.74□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W CMD1P06787 147 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SDH2P21801 266 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YCR051WP25631 222 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TKL2P33315 681 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W APN2P38207 520 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MSR1P38714 643 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W ECM30Q06673 1274 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W GPM2Q12008 311 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W IZH4Q99393 312 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RIF1P29539 1916 aa9.73□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SLD2P34252 453 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MRPL7P36519 292 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W NMD3P38861 518 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W RAD55P38953 406 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SAE2P46946 345 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W ZIP2P53061 704 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W SKY1Q03656 742 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MSH6Q03834 1242 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TPO1Q07824 586 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TAF10Q12030 206 aa9.72□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W ILV2P07342 687 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W MRPL25P23369 157 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W DEP1P31385 405 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W HXT3P32466 567 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YHR202WP38887 602 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W XDJ1P39102 459 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W ALA1P40825 983 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W RFX1P48743 811 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YGL140CP53120 1219 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W PEX31P53203 462 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W FMP30Q02883 468 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YPL034WQ03083 165 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W DDC1Q08949 612 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W NBP2Q12163 236 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W NCA2Q12374 616 aa9.71□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W QCR6P00127 147 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W IMA3P0CW40 589 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W IMA4P0CW41 589 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W KAR4P25583 335 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W AVT3P36062 692 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W PAM1P37304 830 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W GRS1P38088 690 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YBR284WP38150 797 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YBR053CP38235 358 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W CKB2P38930 258 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W YEL023CP39992 682 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W PRK1P40494 810 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W BET4Q00618 327 aa9.7□□□□□ -0.86
BRR1YPR057W SND1Q04007 877 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms