RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A PAL1Q05518 499 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A NRT1Q08485 598 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YPL066WQ12194 479 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RNR1P21524 888 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YBR139WP38109 508 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YHR202WP38887 602 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A UBP6P43593 499 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RSC8P43609 557 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A RNR4P49723 345 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YPL068CQ02749 293 aa0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A BCS1P32839 456 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YBR053CP38235 358 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A NNF2P53253 936 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A STE4P18851 423 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PRP19P32523 503 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MCD4P36051 919 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SIC1P38634 284 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A AFG3P39925 761 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HUL5P53119 910 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SNU56Q03782 492 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YER175W-AQ8TGU4 54 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HEM13P11353 328 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MAL31P38156 614 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A UBP8P50102 471 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A FLC1Q08967 793 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HOS1Q12214 470 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A POM34Q12445 299 aa0.77□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A WHI2P12611 486 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RPB8P20436 146 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A AEP2P22136 580 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A STE14P32584 239 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A BRN1P38170 754 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SPF1P39986 1215 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A NPP2P39997 493 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YIL169CP40442 995 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A NNF1P47149 201 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HFD1Q04458 532 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YLR125WQ12138 136 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PHO8P11491 566 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YMC1P32331 307 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YKL151CP36059 337 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YKL069WP36088 180 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A BZZ1P38822 633 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YIL024CP40543 189 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YJR107WP47145 328 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A UTP8P53276 713 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YPR089WO13585 888 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RPL8BP29453 256 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A FLO10P36170 1169 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YJL068CP40363 299 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A LAS21P40367 830 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PCL10P53124 433 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MCP2Q06567 569 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A LAS17Q12446 633 aa0.76□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ADE2P21264 571 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PEX1P24004 1043 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CTP1P38152 299 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ARC40P38328 384 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A RRP8P38961 392 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A AIM14P53109 570 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CUL3P53202 744 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MTD1Q02046 320 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YVH1Q02256 364 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A DIG1Q03063 452 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MLH3Q12083 715 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A UBX3Q12229 455 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A GIN4Q12263 1142 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YHR112CP38716 378 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MET30P39014 640 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HXT13P39924 564 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YFL067WP43537 175 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HXT17P53631 564 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A HXT15P54854 567 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PSR2Q07949 397 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A IZH3Q07959 543 aa0.75□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A KAR1P11927 433 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A FRS1P15624 595 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ECM1P39715 212 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A GID8P40208 455 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A IRC7P43623 340 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YPT11P48559 417 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A MTC3P53077 123 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A IDP3P53982 420 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A TAF3Q12297 353 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A THR1P17423 357 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A COQ3P27680 312 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SEC65P29478 273 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PEX6P33760 1030 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A ROT2P38138 954 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CCT7P42943 550 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A COQ6P53318 479 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A CCT5P40413 562 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A PIN2Q12057 282 aa0.74□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A SWR1Q05471 1514 aa0.73□□□□□ -2.29
YPL060C-AYPL060C-A STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data0.73□□□□□ -2.29not detected
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 393.6 ms