RNA–Protein interactions for RNA: YMR131C

RRB1, Transcript of Nuclear protein involved in early steps of ribosome biogenesis, yeast

Gene RRB1, Length 1,536 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRB1	YMR131C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	FTR1	P40088	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YTA12	P40341	825 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YGR111W	P53265	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	EEB1	Q02891	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SPO21	Q12411	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RMP1	Q12530	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DAL2	P25335	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CPR7	P47103	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SHE10	P53075	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DUS4	Q06063	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	IES4	Q08561	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	HFI1	Q12060	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	HIF1	Q12373	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SEY1	Q99287	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MOT1	P32333	1867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	POL3	P15436	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DSN1	P40568	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	INA22	P40576	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ORC5	P50874	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ATG1	P53104	897 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YNL146W	P53906	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ROD1	Q02805	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	COQ9	Q05779	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PMS1	P14242	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CDC11	P32458	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RRB1	YMR131C	YIL089W	P40500	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YJR079W	P47126	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ATG16	Q03818	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	IVY1	Q04934	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SFH1	Q06168	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TRM11	Q12463	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MAS2	P11914	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	KAR3	P17119	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	IME1	P21190	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RRT12	P25381	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TRM2	P33753	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	CSG2	P35206	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GPT2	P36148	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MMS4	P38257	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	VHC1	P38329	1120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	BSD2	P38356	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	BRL1	P38770	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	QDR2	P40474	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YNL320W	P42840	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RGD2	P43556	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	TRS85	P46944	698 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YML6	P51998	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RIM8	P53179	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	UFO1	Q04511	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PNP1	Q05788	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	ECM3	Q99252	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YER152C	P10356	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MSH1	P25846	959 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	PLC1	P32383	869 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	POP4	P38336	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	MSG5	P38590	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	HXT5	P38695	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	DYS1	P38791	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRB1	YMR131C	END3	P39013	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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