RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT11P48559 417 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M VEL1P53058 206 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MND1P53102 219 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NPY1P53164 384 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TUB4P53378 473 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL035CP53962 389 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PPM1Q04081 328 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YML082WQ04533 649 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF9Q05027 157 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M HRD3Q05787 833 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR297WQ05899 129 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YCS4Q06156 1176 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YCG1Q06680 1035 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM38Q08179 573 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YAP7Q08182 245 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SIL1Q08199 421 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS54Q12071 889 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M NBP2Q12163 236 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M EMP46Q12396 444 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP7Q12406 477 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL098CQ12496 1037 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M CCH1P50077 2039 aa2.78□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M RIF1P29539 1916 aa2.78□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TOR2P32600 2474 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M KEX1P09620 729 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CUP1-1P0CX80 61 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CUP1-2P0CX81 61 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M KAR3P17119 729 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SCJ1P25303 377 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MSH3P25336 1018 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M APL1P27351 700 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M GSY2P27472 705 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RRN6P32786 894 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ELM1P32801 640 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PTC3P34221 468 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CTM1P38818 585 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SSP1P38871 571 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD55P38953 406 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M GDH3P39708 457 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM14P40012 539 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CNN1P43618 361 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M COS5P47187 383 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HFM1P51979 1187 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HST1P53685 503 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR065CP53751 1116 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DOS2P54858 310 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TOF2Q02208 771 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN4Q03465 531 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ARO80Q04052 950 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M COG4Q06096 861 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CSR1Q06705 408 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX15Q08215 383 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa2.77□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FAB1P34756 2278 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC33P07260 213 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PPR1P07272 904 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YER152CP10356 443 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RGR1P19263 1082 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FPR1P20081 114 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AEP2P22136 580 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DSS4P32601 143 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SGE1P33335 543 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M STE13P33894 931 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HSL7P38274 827 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EXO5P38289 585 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RRM3P38766 723 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BCD1P38772 366 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DYS1P38791 387 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M GGA2P38817 585 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M OSW5P40219 148 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PRK1P40494 810 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YIR007WP40566 764 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YIR014WP40570 242 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SAP185P40856 1058 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M REF2P42073 533 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CIR1P42940 261 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BST1P43571 1029 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM7P47150 247 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PIR3Q03180 325 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR206WQ03695 313 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M GFD1Q04839 188 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PMT7Q06644 662 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M THI20Q08224 551 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RSB1Q08417 382 aa2.76□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS9AO13516 197 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ENO2P00925 437 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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