RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C UFE1P41834 346 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DAS1P47005 663 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C UBX6P47049 396 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C OPI10Q08202 246 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PER33Q12144 273 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C FRE7Q12333 620 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C PTC5Q12511 572 aa4.09□□□□□ -1.75
SUP53tL(CAA)C DAL7P21826 554 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C UBP13P38187 747 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C UBS1P38290 277 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PSY2P40164 858 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C RSM7P47150 247 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ROM1P53046 1155 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C GCR2Q01722 534 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YDR444WQ04093 687 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C DDC1Q08949 612 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C DCS2Q12123 353 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YDR061WQ12298 539 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CEX1Q12453 761 aa4.08□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SAT4P25333 603 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PET127P32606 800 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C XRS2P33301 854 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C MRPL40P36534 297 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ECM13P38195 257 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C NPP2P39997 493 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C DSE1P40077 573 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C UBP7P40453 1071 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YNL144CP53907 740 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SUR7P54003 302 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C HRD3Q05787 833 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C BNA5Q05979 453 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YLR407WQ06070 228 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CUR1Q06469 252 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YOL036WQ08206 761 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YOR296WQ08748 1289 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C GET3Q12154 354 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C APC11Q12157 165 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C NBP2Q12163 236 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YPL066WQ12194 479 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C Q0182Q9ZZW1 134 aa4.07□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C MATALPHA2P0CY08 210 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C HMLALPHA2P0CY09 210 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C MUD1P32605 298 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SGE1P33335 543 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PPS1P38148 807 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C OPY1P38271 328 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PCA1P38360 1216 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YHR078WP38799 552 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YIL108WP40483 696 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C LCB2P40970 561 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C FET5P43561 622 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ASG7P46993 209 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C VHS1Q03785 461 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CDA2Q06703 312 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C RTT10Q08924 1013 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YPL277CQ08989 487 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.06□□□□□ -1.76not detected
SUP53tL(CAA)C TIP41Q12199 356 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YEL077CQ3E7X8 1277 aa4.06□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C ALG1P16661 449 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C TPM1P17536 199 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CKA2P19454 339 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C RNR1P21524 888 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CBP3P21560 335 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C RRT12P25381 491 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C BEM1P29366 551 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C MET22P32179 357 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.05□□□□□ -1.76not detected
SUP53tL(CAA)C KDX1P36005 433 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C GEM1P39722 662 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C UBA2P52488 636 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YGL260WP53056 76 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YPL113CQ02961 396 aa4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C GAL10P04397 699 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C PHO8P11491 566 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CWP1P28319 239 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C TRK2P28584 889 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SEF1P34228 1148 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C SIS2P36024 562 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C EXO1P39875 702 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YJL070CP40361 888 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C CFD1P40558 293 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C DSN1P40568 576 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C THI6P41835 540 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C AIM23P47015 356 aa4.04□□□□□ -1.76
SUP53tL(CAA)C YKE2P52553 114 aa4.04□□□□□ -1.76
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