RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B HIR2P32480 875 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B NIP1P32497 812 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ATO2P32907 282 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B BCK2P33306 851 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TSA1P34760 196 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GEF1P37020 779 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GRX7P38068 203 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG12P38316 186 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B NDT80P38830 627 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B FET3P38993 636 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SAP1P39955 897 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YEL020CP39994 560 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B EAF5P39995 279 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ZRG8P40021 1076 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO73P40031 143 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VFA1P40080 203 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GID8P40208 455 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TOK1P40310 691 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B FYV8P46949 817 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B POL31P46957 487 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR039WP47107 1121 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B NPA3P47122 385 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VEL1P53058 206 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SNO2P53823 222 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GAS3Q03655 524 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RSF1Q05043 376 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B STP3Q05937 343 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SUE1Q06524 206 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GYP1Q08484 637 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B MCA1Q08601 432 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SRO7Q12038 1033 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RCN2Q12044 265 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO21Q12411 609 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RVB2Q12464 471 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL15AP05748 204 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL197C-AP0C5P0 93 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B PYC1P11154 1178 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B HMG1P12683 1054 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SPT15P13393 240 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B OM45P16547 393 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B URA4P20051 364 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ELO2P25358 347 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VAC17P25591 423 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR102CP25608 368 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YJU3P28321 313 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC20P28791 383 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SIN4P32259 974 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B NTH1P32356 751 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B CBF2P32504 956 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TMT1P32643 299 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B UGA4P32837 571 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VBA5P36172 582 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ICS2P38284 255 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR287WP38355 427 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SMF1P38925 575 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B DUN1P39009 513 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TGL3P40308 642 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SER33P40510 469 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B DAK2P43550 591 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B HXT10P43581 546 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B PCL10P53124 433 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ZPR1P53303 486 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ZRG17P53735 605 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VAC7P53950 1165 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG11P53954 548 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B UFD2P54860 961 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS30Q02948 557 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS16Q03308 798 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B STE20Q03497 939 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B HRD3Q05787 833 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B LCB5Q06147 687 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR306CQ06640 478 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TFB4Q12004 338 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TAF10Q12030 206 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B GET3Q12154 354 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B NSI1Q12457 570 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR015CQ12531 247 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YPT1P01123 206 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B COX4P04037 155 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TOM70P07213 617 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD2P07276 1031 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B MCM1P11746 286 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B MRP7P12687 371 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS3P23643 1011 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B RIT1P23796 513 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR006CP25350 157 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B AGP1P25376 633 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B PWP2P25635 923 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TPD3P31383 635 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B MET4P32389 672 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS35P34110 944 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B SIF2P38262 535 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B TDA11P38854 504 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B FLO5P38894 1075 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B ILV3P39522 585 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B MAM1P40065 302 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)BtF(GAA)B YER186CP40101 306 aa0.88□□□□□ -2.27
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