RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W ASG7P46993 209 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YJR079WP47126 109 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W STB4P50104 949 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ALT2P52892 507 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VPS62P53285 467 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W AIM39Q08223 395 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YOR223WQ12015 292 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YOR022CQ12204 715 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YML002WP0CF17 737 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ADH4P10127 382 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SPO16P17122 198 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W AEP2P22136 580 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SEC1P30619 724 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PAH1P32567 862 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YME1P32795 747 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W UIP5P36137 443 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W KHA1P40309 873 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W RPT2P40327 437 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ARG2P40360 574 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W TMA108P40462 946 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ATG36P46983 293 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W THI7Q05998 598 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CIR2Q08822 631 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ACM1Q08981 209 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VPS54Q12071 889 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YDR018CQ12185 396 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SEY1Q99287 776 aa9.82□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W GPI10P30777 616 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W FRE1P32791 686 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VPS41P38959 992 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CCT2P39076 527 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PXA1P41909 870 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W POL31P46957 487 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YNL108CP53929 270 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CDC55Q00362 526 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W MUB1Q03162 620 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PNP1Q05788 311 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YRR1Q12172 810 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W LDB19Q12502 818 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa9.81□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W GCR1P07261 785 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VPS3P23643 1011 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CSE2P33308 149 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SRB2P34162 210 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W HEL1P36113 551 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W RPC37P36121 282 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CCL1P37366 393 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W POP4P38336 279 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SMX2P40204 77 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YIL054WP40524 105 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YJL045WP47052 634 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CPR6P53691 371 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W STP1Q00947 519 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W FRA1Q07825 749 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W MDM38Q08179 573 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VPS5Q92331 675 aa9.8□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W TPK1P06244 397 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W TIF1P10081 395 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W CBF1P17106 351 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data9.79□□□□□ -0.84not detected
BRR1YPR057W GAC1P28006 793 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W BIO2P32451 375 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ERP2P39704 215 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ESL1P40456 1118 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W HLJ1P48353 224 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SLG1P54867 378 aa9.79□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SLY1P22213 666 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W LRE1P25579 583 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ILV6P25605 309 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W MEI4P29467 408 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W LDH1P38139 375 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SHE3P38272 425 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SSP1P38871 571 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W LYS9P38999 446 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W RGD2P43556 714 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PFD1P46988 109 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W URB2P47108 1174 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W MRS2Q01926 470 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SHR3Q02774 210 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W USA1Q03714 838 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W PRM6Q04705 352 aa9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W GAL80P04387 435 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W YPK1P12688 680 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W OAF3P36023 863 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W FLC2P39719 783 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W MKT1P40850 830 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W TAF9Q05027 157 aa9.77□□□□□ -0.85
BRR1YPR057W ESC8Q08119 714 aa9.77□□□□□ -0.85
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