RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	NDC80	P40460	691 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YJR115W	P47152	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YGR111W	P53265	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MUB1	Q03162	620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SKY1	Q03656	742 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SML1	Q04964	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	DAS2	Q12084	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CHS1	P08004	1131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VBA3	P25594	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HXT1	P32465	570 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VBA5	P36172	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SLX1	P38324	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TDA3	P38758	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PHO86	P46956	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TCB2	P48231	1178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	KAP114	P53067	1004 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YGR130C	P53278	816 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ARO80	Q04052	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SDH5	Q08230	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PRC1	P00729	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GAL80	P04387	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	DBF4	P32325	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SEG2	P34250	1132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	POA1	P38218	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YHR202W	P38887	602 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	OPT1	P40897	799 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BRO1	P48582	844 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BOP3	P53958	396 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	STP1	Q00947	519 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	JIP3	O13555	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HAP2	P06774	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	FRE1	P32791	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BLI1	P35727	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	APN2	P38207	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RRT2	P38332	387 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SMF1	P38925	575 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SPC72	P39723	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	JHD1	P40034	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	ASG7	P46993	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MND1	P53102	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	NGL3	Q03210	505 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	VPS60	Q03390	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MDM38	Q08179	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SCJ1	P25303	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GAC1	P28006	793 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PEX2	P32800	271 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MAC1	P35192	417 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	GCS1	P35197	352 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	MRPL7	P36519	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RCK2	P38623	610 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BUD16	P39988	312 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	HOP2	P53187	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BTN2	P53286	410 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PNG1	Q02890	363 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	PRM6	Q04705	352 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	TRE1	Q08919	783 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	SFI1	Q12369	946 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	EMP46	Q12396	444 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GAD1	YMR250W	BI2	P03873	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	BI4	P03879	638 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	TPK1	P06244	397 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	DPB3	P27344	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	YBL036C	P38197	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	APM2	P38700	605 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	TMN3	P40071	706 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	DSE1	P40077	573 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	POL31	P46957	487 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	UFO1	Q04511	668 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GAD1	YMR250W	DDC1	Q08949	612 aa		4.71	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms