RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	GAC1	P28006	793 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YBL036C	P38197	257 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YHL049C	P38722	271 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	XDJ1	P39102	459 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YEL075C	P39972	122 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YER189W	P40104	122 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YFL064C	P43540	174 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YNL108C	P53929	270 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MRS2	Q01926	470 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SPO21	Q12411	609 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TOM1	Q03280	3268 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MSH1	P25846	959 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	GYP6	P32806	458 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MAC1	P35192	417 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RAD55	P38953	406 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YFL052W	P43551	465 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SPP1	Q03012	353 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	URH1	Q04179	340 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ECI1	Q05871	280 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.01	□□□□□ -1.45	not detected
AMD1	YML035C	YOR223W	Q12015	292 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VPS54	Q12071	889 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CIT2	P08679	460 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MET4	P32389	672 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MMS21	P38632	267 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	BRO1	P48582	844 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ADA2	Q02336	434 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	IVY1	Q04934	453 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	OMS1	Q06668	471 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MDM38	Q08179	573 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	AIM39	Q08223	395 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TAF10	Q12030	206 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PMS1	P14242	873 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	AEP2	P22136	580 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PEP7	P32609	515 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CNS1	P33313	385 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SEG2	P34250	1132 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TMN3	P40071	706 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	BFA1	P47113	574 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SLG1	P54867	378 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YPL062W	Q02781	134 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VTI1	Q04338	217 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RMP1	Q12530	201 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	APM4	Q99186	491 aa		6	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	POL3	P15436	1097 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TKL2	P33315	681 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	APM2	P38700	605 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RPC17	P47076	161 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NUT1	P53114	1132 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MET13	P53128	600 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	EAR1	Q03212	550 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	UFO1	Q04511	668 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	GPM2	Q12008	311 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	KAR3	P17119	729 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SFL1	P20134	766 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SWC5	P38326	303 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SAK1	P38990	1142 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TAF1	P46677	1066 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YNL011C	P53980	444 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YML083C	Q04526	418 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SRB2	P34162	210 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ECM1	P39715	212 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TGL3	P40308	642 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TMA108	P40462	946 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PFD1	P46988	109 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ASG7	P46993	209 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YMR187C	Q03236	431 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	AIM41	Q12032	185 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VPS5	Q92331	675 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	END3	P39013	349 aa		5.98	□□□□□ -1.45

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