RNA–Protein interactions for RNA: YLR132C

USB1, Transcript of Putative phosphodiesterase specific for U6 snRNA 3' end modification, yeastyeast

Gene USB1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1YLR132C GPG1P53130 126 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C NRG1Q03125 231 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C YML122CQ03207 126 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C GPR1Q12361 961 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C TMA17Q12513 150 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C ULS1Q08562 1619 aa5.07□□□□□ -1.6
USB1YLR132C MNN4P36044 1178 aa5.06□□□□□ -1.6
USB1YLR132C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USB1YLR132C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USB1YLR132C SNT2P53127 1403 aa5.06□□□□□ -1.6
USB1YLR132C CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C AMA1P50082 593 aa5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C IOC4Q04213 475 aa5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C ASM4Q05166 528 aa5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C TGL5Q12043 749 aa5.05□□□□□ -1.6
USB1YLR132C STU1P38198 1513 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C APN2P38207 520 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C SIC1P38634 284 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C DUG1P43616 481 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C FOL1P53848 824 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C RMP1Q12530 201 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C MYO4P32492 1471 aa5.04□□□□□ -1.6
USB1YLR132C AEP2P22136 580 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C EUG1P32474 517 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C GRX7P38068 203 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C ECM1P39715 212 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C YIR042CP40586 236 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C SET2P46995 733 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C YJR039WP47107 1121 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C REC102Q02721 264 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C YHM2Q04013 314 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C GAD1Q04792 585 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C IRC13Q08630 104 aa5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
USB1YLR132C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
USB1YLR132C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
USB1YLR132C APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YBR071WP38243 211 aa5.02□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ATF1P40353 525 aa5.02□□□□□ -1.61
USB1YLR132C MCM21Q06675 368 aa5.02□□□□□ -1.61
USB1YLR132C LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C PCL5P38794 229 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YHR202WP38887 602 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C HOS4P40480 1083 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ARG5,6Q01217 863 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ECM9Q02202 377 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YMR210WQ03649 449 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C DCS2Q12123 353 aa5.01□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SEC65P29478 273 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C EMP65P40085 556 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C PEX14P53112 341 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C COX18P53239 316 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C RIA1P53893 1110 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SUT2Q12286 268 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ATG11Q12527 1178 aa5□□□□□ -1.61
USB1YLR132C TRM3Q07527 1436 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C PDR12Q02785 1511 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ADE2P21264 571 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C BCD1P38772 366 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YJR120WP47157 116 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SPC105P53148 917 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C BRE5P53741 515 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ARP4P80428 489 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SGO1Q08490 590 aa4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USB1YLR132C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C KAR1P11927 433 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C HIS7P33734 552 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C RNR4P49723 345 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SLD3P53135 668 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SKY1Q03656 742 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C VHS3Q08438 674 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C HFI1Q12060 488 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YPR027CQ12079 277 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C APM4Q99186 491 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C PDR10P51533 1564 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C DNF3Q12674 1656 aa4.98□□□□□ -1.61
USB1YLR132C SEC15P22224 910 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YHR112CP38716 378 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C HXT6P39003 570 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C HXT7P39004 570 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C FMP52P40008 231 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C NUG1P40010 520 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C TEX1P53851 422 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C COG6P53959 839 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C YLR407WQ06070 228 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C GDB1Q06625 1536 aa4.97□□□□□ -1.61
USB1YLR132C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
USB1YLR132C ERG20P08524 352 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
USB1YLR132C SWI6P09959 803 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms