RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	REC102	Q02721	264 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	HFI1	Q12060	488 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	NTO1	Q12311	748 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	RMP1	Q12530	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YIR042C	P40586	236 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	TAF1	P46677	1066 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	AMA1	P50082	593 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	AIM39	Q08223	395 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	APM4	Q99186	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YBT1	P32386	1661 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	SWI6	P09959	803 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	DAL3	P32459	195 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	ELO3	P40319	345 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	NIT2	P47016	307 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	MUP1	P50276	574 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	COX18	P53239	316 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	COG6	P53959	839 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	ERG4	P25340	473 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	KTR4	P38131	464 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	GIP4	P39732	760 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	PEX14	P53112	341 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YLR407W	Q06070	228 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	SGO1	Q08490	590 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YPR027C	Q12079	277 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YKU70	P32807	602 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	FAT1	P38225	669 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YBR053C	P38235	358 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SKY1	Q03656	742 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	VHS3	Q08438	674 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	TRM13	Q12383	476 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PET127	P32606	800 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	TFC4	P33339	1025 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	TRM2	P33753	639 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YNL195C	P40168	261 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	FRE5	Q08908	694 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	ECM3	Q99252	613 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	BUD3	P25558	1636 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YCR015C	P25616	317 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PLC1	P32383	869 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YKL222C	P35995	705 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	GRX7	P38068	203 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	DUN1	P39009	513 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	HOS4	P40480	1083 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	BAP3	P41815	604 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SPC105	P53148	917 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	MTL1	P53214	551 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RNT1	Q02555	471 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YPS7	Q06325	596 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	BIT2	P38346	545 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SUL1	P38359	859 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	LYS9	P38999	446 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	GET2	P40056	285 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	STH1	P32597	1359 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	KAR1	P11927	433 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	FMO1	P38866	432 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	EMP65	P40085	556 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	VID28	P40547	921 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	AIM21	P40563	679 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YJL163C	P46996	555 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	ADY4	Q05955	493 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	VPS36	Q06696	566 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms