RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
PIR3	YKL163W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	ROT1	Q03691	256 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RCF1	Q03713	159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	SGD1	Q06132	899 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	REH1	Q06709	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YER152C	P10356	443 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	PHO81	P17442	1178 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
PIR3	YKL163W	KCC4	P25389	1037 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	VBA3	P25594	458 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	MLS1	P30952	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	DOM34	P33309	386 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	SAS3	P34218	831 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YEL1	P34225	687 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RER2	P35196	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YHL041W	P38730	149 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	SHC1	P39000	512 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	MEF2	P39677	819 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	HIS6	P40545	261 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	PLB2	Q03674	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	MED1	Q12321	566 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YLR358C	O13565	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RAD53	P22216	821 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	MEF1	P25039	761 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
PIR3	YKL163W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	CTS1	P29029	562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	IMP2'	P32351	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	PXA2	P34230	853 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
PIR3	YKL163W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	GCN5	Q03330	439 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	SSP2	Q08646	371 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	RKM4	Q12504	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIR3	YKL163W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	INO1	P11986	533 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MCM10	P32354	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YKU70	P32807	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	EMP65	P40085	556 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	IRC3	Q06683	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	VPS5	Q92331	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RIM15	P43565	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MSM1	P22438	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RER1	P25560	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YKL107W	P34251	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RGD1	P38339	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CKB2	P38930	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ACA1	P39970	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ESL1	P40456	1118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YIL089W	P40500	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ENV11	P53246	860 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
PIR3	YKL163W	VPS30	Q02948	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	ERO1	Q03103	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PHM6	Q05637	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RMP1	Q12530	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	GAL10	P04397	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CMP2	P14747	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	NUP120	P35729	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	KTR4	P38131	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RFC5	P38251	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	NIT2	P47016	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HNT2	P49775	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MET13	P53128	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	RSC1	P53236	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	COG8	Q04632	607 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CYB2	P00175	591 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
PIR3	YKL163W	SRD1	P09007	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	HOM3	P10869	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	MRP7	P12687	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PIR3	YKL163W	SFL1	P20134	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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