RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W DAP1Q12091 152 aa2.74□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ECM29P38737 1868 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TUB2P02557 457 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CDC20P26309 610 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W APL1P27351 700 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97not detected
SSQ1YLR369W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W TAT2P38967 592 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CWC24P53769 259 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W DNM1P54861 757 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RXT3Q07458 294 aa2.73□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CUP1-1P0CX80 61 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W CUP1-2P0CX81 61 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SNF3P10870 884 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W AGP1P25376 633 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W SBA1P28707 216 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W VAB2P40003 282 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W LYS14P40971 790 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YFH7P43591 353 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W HFM1P51979 1187 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ALD6P54115 500 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
SSQ1YLR369W VPS16Q03308 798 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YDR306CQ06640 478 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W GPB1Q08886 897 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W HMI1Q12039 706 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W PSF3Q12146 194 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W VAC8P39968 578 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W NUG1P40010 520 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W YGL176CP46945 554 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W VID30P53076 958 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W ROT1Q03691 256 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W UBX5Q06682 500 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W MET7Q08645 548 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
SSQ1YLR369W TEL1P38110 2787 aa2.72□□□□□ -1.97
SSQ1YLR369W FUN30P31380 1131 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W EUG1P32474 517 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NUP133P36161 1157 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MAM1P40065 302 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MND2P40577 368 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GDE1Q02979 1223 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ADY3Q07732 790 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MDM38Q08179 573 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa2.71□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W RPC82P32349 654 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YKL151CP36059 337 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YBL028CP38202 106 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YAP1801P38856 637 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data2.7□□□□□ -1.98not detected
SSQ1YLR369W SHE9Q04172 456 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W HRQ1Q05549 1077 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PNS1Q12412 539 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PRD1P25375 712 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W RGT1P32862 1170 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W LST4P34239 828 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W RSC8P43609 557 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MET12P46151 657 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MNN10P50108 393 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SRT1Q03175 343 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YAP6Q03935 383 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ESC2Q06340 456 aa2.7□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W EMC1P25574 760 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CDC12P32468 407 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GIC1P38785 314 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W JHD1P40034 492 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
SSQ1YLR369W YLR224WQ05947 369 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TPO1Q07824 586 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W XYL2Q07993 356 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PCL8Q08966 492 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W OSW2Q12202 724 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W VMA2P16140 517 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CAD1P24813 409 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PER1P25625 357 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NOC2P39744 710 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ZRG8P40021 1076 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SKP2P42843 763 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CDA1Q06702 301 aa2.69□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W HIS5P07172 385 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MRP7P12687 371 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PRI2P20457 528 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W DCG1P32460 244 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ATG19P35193 415 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W POA1P38218 177 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms