RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W YGR021WP53212 290 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YNL115CP53925 644 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W ADA2Q02336 434 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W YML083CQ04526 418 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W RGA2Q06407 1009 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W ZPS1Q12512 249 aa4.4□□□□□ -1.7
SPC105YGL093W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data4.4□□□□□ -1.71not detected
SPC105YGL093W PRR1P28708 518 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SLA2P33338 968 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YBR284WP38150 797 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W INP51P40559 946 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YJL045WP47052 634 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W STP1Q00947 519 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SPO71Q03868 1245 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W VPS38Q05919 439 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YPL216WQ08964 1102 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MNL2Q12205 849 aa4.4□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TPK1P06244 397 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CDC33P07260 213 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RNR1P21524 888 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SPC72P39723 622 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W DSE1P40077 573 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SIP5P40210 489 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W LSB6P42951 607 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W VPS25P47142 202 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ERG5P54781 538 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W LAA1P39526 2014 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W UBR2Q07963 1872 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CYC8P14922 966 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SEC65P29478 273 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SMC1P32908 1225 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CCL1P37366 393 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PHO86P46956 311 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MND1P53102 219 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W DRN1P53255 507 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SSL2Q00578 843 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TBF1Q02457 562 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YPR027CQ12079 277 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ATG9Q12142 997 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W AHC1Q12433 566 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ECM3Q99252 613 aa4.39□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ADE3P07245 946 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W EST1P17214 699 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CSE2P33308 149 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPC25P35718 212 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W HEL1P36113 551 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W STR2P47164 639 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PUS2P53167 370 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.38□□□□□ -1.71 RIP-Chip
SPC105YGL093W EEB1Q02891 456 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data4.38□□□□□ -1.71not detected
SPC105YGL093W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SLX4Q12098 748 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ADK2P26364 225 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PEP7P32609 515 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W BLI1P35727 113 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PTC4P38089 393 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SAD1P43589 448 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W STU2P46675 888 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W NUT1P53114 1132 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YMR018WQ04364 514 aa4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W JIP3O13555 125 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ADE4P04046 510 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CHS1P08004 1131 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W AEP2P22136 580 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W GAC1P28006 793 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W EFB1P32471 206 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W XRS2P33301 854 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TSA1P34760 196 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TBS1P38114 1094 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TDA3P38758 523 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SBE2P42223 864 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YNL034WP53963 612 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YNL018CP53976 612 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TRE1Q08919 783 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TUP1P16649 713 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CKI1P20485 582 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RAD27P26793 382 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MCM2P29469 868 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SRB4P32569 687 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TKL2P33315 681 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W KIC1P38692 1080 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CCC2P38995 1004 aa4.37□□□□□ -1.71
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