RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YLR125WQ12138 136 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data10.12□□□□□ -0.79not detected
RDN25-1RDN25-1 BIM1P40013 344 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MET18P40469 1032 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 SQS1P53866 767 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PRP9P19736 530 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 SAS3P34218 831 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 FES1P38260 290 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PDS1P40316 373 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 FAR7P43592 221 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 KAP114P53067 1004 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 ACM1Q08981 209 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MSH5Q12175 901 aa10.12□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YEL076C-AP0CX16 216 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YLR464WP0CX17 216 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 TEC1P18412 486 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 BAS1P22035 811 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 KRE2P27809 442 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 UBP5P39944 805 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YEL076CP39971 216 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 CPR6P53691 371 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 ESBP6P53918 673 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 ADE3P07245 946 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 CHS3P29465 1165 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 TOF1P53840 1238 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 FUS1P11710 512 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PRP6P19735 899 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 TBS1P38114 1094 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 APD1P38281 316 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 URB2P47108 1174 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 RSM28Q03430 361 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 HFD1Q04458 532 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 DAS2Q12084 232 aa10.11□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 URE2P23202 354 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 POL4P25615 582 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YHR020WP38708 688 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 ATG1P53104 897 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 RET3P53600 189 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PYC1P11154 1178 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 POL3P15436 1097 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MSH2P25847 964 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 UBC6P33296 250 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 CIK1Q01649 594 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MDM1Q01846 1127 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 CSM3Q04659 317 aa10.1□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 HXT1P32465 570 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MAG2Q06436 670 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YPR172WQ06608 200 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 MLH2Q07980 695 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 SNF3P10870 884 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 NAM7P30771 971 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 STB2P46679 850 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 ISM1P48526 1002 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 PSP2P50109 593 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 HOS2P53096 452 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 COP1P53622 1201 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YPR078CQ06813 372 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 KIP1P28742 1111 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 GCG1P32656 232 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 UBX4P54730 416 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 YDL057WQ07379 328 aa10.09□□□□□ -0.79
RDN25-1RDN25-1 GEF1P37020 779 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 GNP1P48813 663 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 PGA2P53903 129 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 TMA46Q12000 345 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 DPB2P24482 689 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 ECI1Q05871 280 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 YOL036WQ08206 761 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 RTT10Q08924 1013 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 POL30P15873 258 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 HIR2P32480 875 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 SMX2P40204 77 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 THI6P41835 540 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 SET4P42948 560 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 HPC2Q01448 625 aa10.08□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 FOB1O13329 566 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 ILV1P00927 576 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 STN1P38960 494 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 SRB7P47822 140 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 RIM8P53179 542 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 FOL1P53848 824 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data10.07□□□□□ -0.8not detected
RDN25-1RDN25-1 AIM41Q12032 185 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 PET494P07390 489 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 SAM2P19358 384 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 YKL050CP35736 922 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 ECM2P38241 364 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 NDT80P38830 627 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 PEX18P38855 283 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 IRR1P40541 1150 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 NBP1P52919 319 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 MRM2P53123 320 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 RPM2Q02773 1202 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 IRC3Q06683 689 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 SOG2Q08817 791 aa10.07□□□□□ -0.8
RDN25-1RDN25-1 RUP1Q12242 671 aa10.07□□□□□ -0.8
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