RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL150WQ12152 901 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HRT3Q12347 344 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CTF3Q12748 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HMG2P12684 1045 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CHS2P14180 963 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TRK2P28584 889 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MRF1P30775 413 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM2P33753 639 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TTI1P36097 1038 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M AGP2P38090 596 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M THI6P41835 540 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL045WP47052 634 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ALT1P52893 592 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX14P53112 341 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MUB1Q03162 620 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RGA2Q06407 1009 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SDH5Q08230 162 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SLX4Q12098 748 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PUS1Q12211 544 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL80P04387 435 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PCK1P10963 549 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO8P11491 566 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M BIK1P11709 440 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SIR1P21691 654 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RRT12P25381 491 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M BIO2P32451 375 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HMT1P38074 348 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PTC4P38089 393 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RGD1P38339 666 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP1P38696 384 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M GEM1P39722 662 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TGL3P40308 642 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M DAK2P43550 591 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ZAP1P47043 880 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SHE10P53075 577 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR061CP53747 219 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SLG1P54867 378 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC5P89102 971 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M GCN5Q03330 439 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M WAR1Q03631 944 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M NSE5Q03718 556 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TIF35Q04067 274 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM6Q04705 352 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MLH2Q07980 695 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL075CQ08234 1294 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HIS5P07172 385 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CHS1P08004 1131 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FUS1P11710 512 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HCM1P25364 564 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MSH2P25847 964 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M KIP1P28742 1111 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PSO2P30620 661 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M STE5P32917 917 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M XRS2P33301 854 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SLA2P33338 968 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M DUG2P38149 878 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR284WP38150 797 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SHE3P38272 425 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M LEO1P38439 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M KIC1P38692 1080 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M BIM1P40013 344 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M LCB2P40970 561 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TOS3P43637 560 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP8P53276 713 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR130CP53278 816 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM8P57744 87 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ADA2Q02336 434 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HER2Q03557 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR344CQ05510 147 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX19Q07418 342 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YPQ1Q12010 308 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF10Q12030 206 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M APM4Q99186 491 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M VMA1P17255 1071 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M STE11P23561 717 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M PPH22P23595 377 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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