RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL150WQ12152 901 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HRT3Q12347 344 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CTF3Q12748 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HMG2P12684 1045 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS2P14180 963 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TRK2P28584 889 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MRF1P30775 413 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM2P33753 639 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TTI1P36097 1038 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J AGP2P38090 596 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J THI6P41835 540 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL045WP47052 634 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ALT1P52893 592 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX14P53112 341 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MUB1Q03162 620 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RGA2Q06407 1009 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SDH5Q08230 162 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SLX4Q12098 748 aa2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PUS1Q12211 544 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TRP2P00899 507 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL80P04387 435 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PCK1P10963 549 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO8P11491 566 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J BIK1P11709 440 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SIR1P21691 654 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RRT12P25381 491 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J BIO2P32451 375 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HMT1P38074 348 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PTC4P38089 393 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RGD1P38339 666 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP1P38696 384 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J GEM1P39722 662 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TGL3P40308 642 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J DAK2P43550 591 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ZAP1P47043 880 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SHE10P53075 577 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR061CP53747 219 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SLG1P54867 378 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC5P89102 971 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J GCN5Q03330 439 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J WAR1Q03631 944 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J NSE5Q03718 556 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TIF35Q04067 274 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM6Q04705 352 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MLH2Q07980 695 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL075CQ08234 1294 aa2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SGT2Q12118 346 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PDH1Q12428 516 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HIS5P07172 385 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS1P08004 1131 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FUS1P11710 512 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HCM1P25364 564 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MSH2P25847 964 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J KIP1P28742 1111 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PSO2P30620 661 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J STE5P32917 917 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J XRS2P33301 854 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SLA2P33338 968 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J DUG2P38149 878 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR284WP38150 797 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SHE3P38272 425 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J LEO1P38439 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J KIC1P38692 1080 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J BIM1P40013 344 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J LCB2P40970 561 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TOS3P43637 560 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP8P53276 713 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR130CP53278 816 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM8P57744 87 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ADA2Q02336 434 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HER2Q03557 464 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR344CQ05510 147 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX19Q07418 342 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YPQ1Q12010 308 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF10Q12030 206 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J APM4Q99186 491 aa2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA1P17255 1071 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J STE11P23561 717 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J PPH22P23595 377 aa2.83□□□□□ -1.96
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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