RNA–Protein interactions for RNA: YPR087W

VPS69, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene VPS69, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS69	YPR087W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	PDR18	P53756	1333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MET22	P32179	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YIR007W	P40566	764 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MAL11	P53048	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YGL242C	P53066	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MLC1	P53141	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TMA17	Q12513	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
VPS69	YPR087W	MEF1	P25039	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	REC104	P33323	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YEL1	P34225	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	GPB2	P39717	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	NIT1	P40447	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	DAM1	P53267	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	CAF120	P53836	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	UBP16	Q02863	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	HFD1	Q04458	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	IRC3	Q06683	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TRE2	Q08693	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	PRO1	P32264	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	BAP2	P38084	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	PFF1	P38244	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	ACO2	P39533	789 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YIR014W	P40570	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	VPS72	Q03388	795 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	DPH6	Q12429	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SRD1	P09007	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	RAD18	P10862	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SPC29	P33419	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	CCZ1	P38273	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YJL045W	P47052	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TNA1	P53322	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SRC1	Q03707	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TPP1	Q03796	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	COG8	Q04632	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	THI3	Q07471	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	POM152	P39685	1337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	DPB3	P27344	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MGM1	P32266	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	SEC6	P32844	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YKL222C	P35995	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	ICP55	P40051	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	TOK1	P40310	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	MRPS35	P53292	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	ERO1	Q03103	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	RRI2	Q12348	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	PMD1	P32634	1753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS69	YPR087W	CDC9	P04819	755 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	PIF1	P07271	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	GPT2	P36148	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	ERT1	P38140	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	RRM3	P38766	723 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	MGS1	P40151	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	REH1	Q06709	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	RIM20	Q12033	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	SLX4	Q12098	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	KRE2	P27809	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	YSC84	P32793	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	SLA2	P33338	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	YER158C	P40095	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	DAS1	P47005	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	EAF6	P47128	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	JJJ3	P47138	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS69	YPR087W	PEX14	P53112	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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