RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W TFA2P36145 328 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W RRT2P38332 387 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W BCD1P38772 366 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YJL049WP47048 450 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W ARG8P18544 423 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W POL4P25615 582 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W VID24P38263 362 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YJR008WP47085 338 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YGR021WP53212 290 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W MAL13P53338 473 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W AAD4Q07747 329 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YMR085WP0CF18 432 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W EAF6P47128 113 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W RTA1P53047 317 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W MED2Q12124 431 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CRP1P38845 465 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W SAM1P10659 382 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YJR054WP47114 497 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YRR1Q12172 810 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W SLY1P22213 666 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W VPS21P36017 210 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YTA12P40341 825 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CCT7P42943 550 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W LAM5P43560 674 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YLR462WO13556 202 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W AFT1P22149 690 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CLB4P24871 460 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W SEC21P32074 935 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W NOP4P37838 685 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YHL049CP38722 271 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YEL075CP39972 122 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YER189WP40104 122 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YFL064CP43540 174 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YJR107WP47145 328 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CUE3P53137 624 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YDL073WQ07454 984 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W DCS2Q12123 353 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YBL111CQ3E7Y5 667 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CHO2P05374 869 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W INO1P11986 533 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W MCM4P30665 933 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W GAA1P39012 614 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W RIO2P40160 425 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W PXA1P41909 870 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W NHP10Q03435 203 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W CDC6P09119 513 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W WHI2P12611 486 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W REG2P38232 338 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W MMM1P41800 426 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W RET1P22276 1149 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YJR079WP47126 109 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W YML037CQ03703 340 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W FMP25Q08023 583 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-3YGR296W SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W BSD2P38356 321 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W KAR4P25583 335 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W MGT1P26188 188 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W YRB1P41920 201 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W PHM6Q05637 104 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W NUR1Q12066 484 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W REC8Q12188 680 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W URA1P28272 314 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W BRF1P29056 596 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W SRP68P38687 599 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W UBX4P54730 416 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W YKL068W-AQ3E826 78 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W DAL7P21826 554 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W SEC26P41810 973 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W IES3Q12345 250 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W TFC1P32367 649 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W EXO5P38289 585 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W TDA3P38758 523 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W HFM1P51979 1187 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W EEB1Q02891 456 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W ATG17Q06410 417 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W NAM7P30771 971 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W HIR1P32479 840 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W VFA1P40080 203 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W NOG2P53742 486 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W VTI1Q04338 217 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W PUP2P32379 260 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W ADD66P36040 267 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W VHC1P38329 1120 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W PCM1P38628 557 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W GCN20P43535 752 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W YPL191CQ08930 360 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W CHS3P29465 1165 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W KTR2P33550 425 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W SMF1P38925 575 aa8.32□□□□□ -1.08
YRF1-3YGR296W RET3P53600 189 aa8.32□□□□□ -1.08
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